红色毛癣菌孢子期与萌芽期基因表达比较分析.pdf

中国科学 C辑: 生命科学 2007 年 第 37 卷 第 2 期: 227~233 孢子捕捉仪 / 红色毛癣菌孢子期与萌芽期基因表达比较分析 杨 莉①② 王玲玲② 彭俊平② 于 录② 刘 涛② 冷文川② 杨 剑② 陈立宏② 张文亮② 张 骞② 齐义鹏① 金 奇①②③* (① 武汉大学生命科学学院, 武汉 430072; ② 中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室, 北京 100176; ③ 中国医学科学院病原生物学研究所, 北京 100730) 摘要 红色毛癣菌(Trichophyton rubrum)是最常见和流行范围最广的一种浅部感染真菌, 它的 孢子萌发是和致病密切相关且非常重要的发育过程. 为研究出芽时生理、生化以及细胞学方面的 改变, 从红色毛癣菌 cDNA 文库中选取了 3364 条有明确功能注释的表达序列标签(ESTs)制备了 cDNA 芯片, 对孢子期及萌芽期进行了基因表达变化的研究. 数据分析表明, 孢子萌发过程中有 335 个基因表达上调, 主要是翻译、 修饰蛋白及结构蛋白. 细胞壁和细胞膜组分大量合成, 暗示 它们是细胞形态发生的基础. 二组分信号转导系统的组成部分表达上调, 推测它可能在红色毛癣 菌孢子萌发过程中起着重要作用. 各种代谢途径表达旺盛, 特别是参与糖酵解和氧化磷酸化的基 因基本都上调, 说明在氧气和葡萄糖充足的环境下, 孢子主要通过有氧呼吸获得能量. 本研究对 了解红色毛癣菌孢子萌发过程中基因表达的变化及其信号转导和代谢特点提供了重要线索, 对 其他浅部真菌的研究也具有重要意义. 关键词 红色毛癣菌(Trichophyton rubrum) 孢子 萌发 cDNA 芯片 表达序列标签(EST) 基因表达 浅部真菌是真菌中流行范围最广的致病原, 可 选择高致病性的红色毛癣菌作为浅部真菌的代表, 以引起体癣、股癣、手癣、足癣等疾病[1]. 而且 60% 开展大规模结构与功能基因组研究, 能够从分子水 以上的浅部真菌病由红色毛癣菌(Trichophyton ru- 平上了解浅部真菌的生理生化过程, 为其诊断和治 brum)所引起[2], 它不仅可引起上述人体各部位的癣 疗提供线索和依据, 促进目前浅部真菌的研究. 病, 还可引起脓癣、脓肿和肉芽肿等深部感染, 是我 真菌基因组庞大, 并含有大量的非编码序列, 为 国最常见的皮肤癣菌[1]. 随着生活水平的提高, 人们 后续的基因预测和功能注释带来了困难. 而表达序 对生活质量的要求也越来越严格, 浅部真菌的研究 列标签(expressed sequence tag, EST)能从基因水平真 日益受到关注. 目前酵母菌(Saccharomyces cerevisia) 实地反映基因的表达, 更准确地提供基因结构与功 作为单细胞真菌的代表已经在真核细胞的遗传、 生 能