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2017-05-11 发布于上海
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Exploration of Small RNAs 英文参考文献

Review ExplorationofSmallRNAs Hideya Kawaji, Yoshihide Hayashizaki* ABSTRACT (i)smallRNAproduction:aprecursorRNAiscleavedto produceasmalldouble-strandedRNA(dsRNA),wherethe precursorcanbeahairpin-structuredRNAoralongdsRNA inthecaseofmicroRNA(miRNA)orsmallinterferingRNA (siRNA),respectively;(ii)RNPassembly:theresultingsmall RNAisloadedintoanRNPcomplex,and(iii)genesilencing: theRNPsuppressesitstargetgene,wherethetarget recognitionisguidedbytheloadedsmallRNA,andthe silencingactivityismediatedbytheproteinscomposingthe RNPatthepost-transcriptionalortranscriptionallevel[5]. Thismachineryisadoptedinawiderangeoforganisms. Althoughtheoverallpathwaysresembleeachother,thereare substantialdifferencesbetweenorganisms(Figure1).In metazoans,twoRNaseIIIendonucleases,DroshaandDicer, contributetoaprocessofsmallRNAproduction.Drosha cleavesalongprimarytranscriptincludingastem-loop (termedprimarymiRNA,orpri-miRNA)nearthebaseofthe stemtoreleaseahairpinstructure,termedprecursormiRNA (pre-miRNA).Dicercleavespre-miRNAoralongdsRNA (precursorofsiRNA)toproduceasmalldsRNA,onlyone strandofwhichisloadedintotheRNP[6].Homosapiens,Mus musculus,andCaenorhabditiseleganshaveonlyoneDicergene, whichcontributestobothmiRNAandsiRNAproduction.On theotherhand,thesetworolesareencodedbydistinctgenes inseveralorganisms.Drosophilamelanogasterhastwoproteins ofDicer,DCR-1,andDCR-2,whichareusedformiRNAand siRNA,respectively[7].ArabidopsisthalianahasfourDicer orthologues,DCL1toDCL4,butnoDrosha.DCL1 F orseveraldecades,onlyalimitednumberof noncodingRNAs,suchasribosomalandtransferRNA, havebeenstudiedinanydepth.Inrecentyears, additionalspeciesofnoncodingRNAshaveincreasinglybeen discovered.Ofthese,smallRNAspeciesattractparticular interestbecauseoftheiressentialrolesinprocessessuchas RNAsilencingandmodi?cations.Detailedanalysesrevealed severalpathwaysassociatedwiththefunctionofsmallRNAs. Althoughthesepathwaysshowevolutionalconservation, therearesubstantialdifferences.Advancedtechnologiesto pro?leRNAshaveacceleratedthe?eld