紫苏β-酮脂酰ACP合成酶基因家族生物信息学分析.pdf

山西农业科学2017，45(3)：321—324 JournalofShanxiAgriculturalSciences doi：10．39696．issn．1002-2481．2017．03．01 紫苏p一酮脂酰 ACP合成酶基因家族生物信息学分析 李 璐，梁 倩 ，安 茜，周雅莉，王计平 (山西农业大学农学院，山西太谷030801) 摘 要：紫苏作为一种新型油料作物，富含多种不饱和脂肪酸，其中，O一／亚麻酸含量高达61．2％。B一酮脂酰ACP 合成酶在植物脂肪酸合成中起着关键性作用。对紫苏B一酮脂酰ACP合成酶(KAS)基因家族及其编码蛋白进行了 详细的生物信息学分析。结果表明，紫苏KAS家族蛋白中，KAS1I基因编码的氨基酸数最多，KAS皿B最少，均为疏 水性脂溶蛋白，无信号肽，推测该家族蛋白为非分泌型蛋白；家族蛋白都含有KAS保守结构域，属于cond—enzymes 超蛋白家族 ，二级结构组成基本相同。系统进化树分析结果表明，紫苏KASI与拟南芥KASI、紫苏KAS1I与油茶 KASII、紫苏 KASIII与油茶 KASm亲缘关系最近，紫苏与油棕、油棕榈 KAS酶家族亲缘关系较远。研究结果可为 深入探究紫苏脂肪酸合成机制奠定理论基础。 关键词 ：紫苏 ；B一酮脂酰ACP合成酶(KAS)；生物信息学分析 中图分类号：S565．9 文献标识码 ：A 文章编号：1O02—2481(2017)03—0321—04 BioinformaticsAnalysisofD—ket0acyl—acylCarrierProtein SynthaseGeneFamilyinPerillafrutescens LILu，LIANGQian，ANXi，ZHOUYali，WANGJiping (CollegeofAgronomy，ShanxiAgriculturalUniversity，Taigu030801，China) Abstract：PeriUafrutescensiSanewoilcropcontainingallkindsofunsaturatedfattyacidsinitsseedsoil．Theoilcontainshiigher levelofd-linolenicacid，upto61．2％．B-ketoacyl-acylcarrierproteinsynthasegenefamilyplaysanimportantroleinfatty acid synthesisinplant．Inthisstudy．theKASfamilyproteinswereanalyzedwithbioinformaticstools．TheresultsshowedthatKASⅡgene encodedthemaximum numberofaminoacids．but／CASIIIBwashteleastinperillaKASfamilyproteins．Allofthemwerehydrophobic lipid solubleproteinswithoutsignalpeptide．Thus，hteproteinfamilywaspredictedasnon-secretoryproteins．KASproteinfamily containedKASconserveddomain，belongingtohtecond-enzymessuperproteinfamily，thesecondarystructureelementsweresimilar． PhylogenetictreeanalysisshowedhtatPfKASIhadcloserelationshipwithAtKASI，PfKASIIandPfKASIIIhadtheclosegenetic relationshipcomparingwithCoKASⅡandCoKASIl1．respectively．Theyhadhtefarthergeneticrelationshipwithotherspecies．T