IPA软件试用指南.pdf

INGENUITY PATHWAY ANALYSIS Ingenuity Pathway  Analysis 试用指导 上海康昱盛信息科技有限公司 2014/7/12 1 目录 1. 第一次使用 2. 软件相关设置 3. 使用IPA查询搜索并构建个性化网络 4. 使用Bioprofiler功能进行批量查询(需额外申请) 5. 上传数据并进行一次Core Analysis 6. 如何查看分析结果 7. 如何进行Comparison Analysis 8. 其他功能简介 2 第一次使用 运行环境准备 IPA是一款全图形化界面的Java应用程序，其运算 完全基于Ingenuity Knowledge Base收集的生命科 学数据库的大数据云计算，因此您需要有稳定快 速的互联网连接即可。 1. 硬件： 1. 高速互联网连接，推荐10Mbps的有线网络或4G 无线网络 2. 推荐使用64位运行环境，内存大于4GB （最低2GB ） 3. 所有计算过程基于云计算，对本地计算机的计算 性能无要求 2. 操作系统： 1. 推荐：Win 7, Mac OS 64位 2. 可用：Win XP ，Mac OS 32位 3. 软件环境： 1. 浏览器：推荐Waterfox （目前最稳定64位浏览 器），其它如IE，Chrome均支持 2. Java，安装对应浏览器版本的Java运行环境，使用 浏览器登录 自动检测安装即可 3 第一次使用 软件登陆 1. IPA的打开是使用账号密码登录网页后自动激 活JAVA客户端的方式登录为主， /login 选择 ，在登陆界面输入用户名 密码 ，遗忘密码的话就点击下 方 forgot password取回即可。 2. 打开过程中，如果有任何警告框弹出提示安 全问题，均选择always allow即可。 3. 如果在运行过程中有打开错误请参照下面方 法调试： 1. 确保Internet连接稳定快速，尤其是出国网速； 2. 清空Java缓存 1. Windows 开始菜单 搜索 configure Java，打开 2. 窗口底部选择Temporary Internet Files, 点击 “Settings” 按钮。 3. 点击Delete Files 4. 选择所有可选框并点击“OK” 。 4 软件界面 工作流快捷起始按 钮，大部