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棉花VP基因家族鉴定及其表达分析论文
Identification and expression analysis of VP
gene family in cotton
A Dissertation Submitted to
The Graduate School of Henan University
In Partial Fulfillment of the Requirements
For the Degree of
Master of Science
By
Zhao Xiaojie
Supervisor: Prof. Ye Wuwei
Prof. Song Chunpeng
May ,2015
摘 要
棉花是最重要的纤维作物,也是盐碱地的先锋作物。开展棉花耐盐性研究,提
高棉花的耐盐性,充分利用我国盐碱地已成为重要的研究课题。焦磷酸酶
(pyrophosphatase ,PPase )是以焦磷酸(pyrophosphate ,PPi )为底物的水解酶,
+ +
H -PPase (H -translocating inorganicpyrophosphatase )是液泡膜上的一种重要质子泵,
在调控细胞膨胀、H+ 电化学梯度、无机离子、有机酸和糖类等次级主动运输过程中
发挥着重要作用。在低温、干旱、高浓度NaCl 和厌氧条件下,可以促使 VP 基因的
表达,维持细胞内部平衡,可以提高植物的抗逆能力。本研究对棉花基因组中 VP
基因家族成员进行了系统分析,利用雷蒙德氏棉、亚洲棉(石系亚1 号)和陆地棉( 中
9807、中s9612、中9409、GK50、Y2067 和GZ)为实验材料,对 VP 基因各家族成
员进行克隆,并根据盐胁迫(0.4% )后各基因成员的表达量变化和转基因种子的耐
盐性萌发能力对VP 基因进行功能分析,主要研究结果如下:
1.比较系统的分析了棉花A 、D 基因组中的 VP 基因家族成员。利用棉属二倍体雷
蒙德氏棉(D 组)和亚洲棉(A 组)基因组信息,以GhVP(Gene Bank No. :ADN96173.1)
序列为参考序列,共鉴定出13 个 VP 基因成员,其中A 组6 个(GaVP1-GaVP6) ,D
组7 个(GrVP7-GrVP13) ,是一类在植物进化中相对比较保守的家族。
2 .分析了VP 基因家族的进化关系。从进化树分析可知,同一物种内的VP 基因序
列相似性较高,亲缘关系也相对较近;基因结构分析结果显示,大部分 VP 基因的
外显子数量都为7-8 个,少数 VP 基因的外显子数量差异较大,1-14 个不等;对保
守结构域分析可知,VP 基因成员都具有多个相对保守的结构域,如肉豆蔻基化位
点,酪蛋白激酶位点Ⅱ,蛋白激酶磷酸化位点等,为进一步研究棉花中 VP 基因的
功能提供了重要依据。
3 .研究了 VP 基因家族的表达水平。荧光定量结果表明,VP 基因成员在不同组织
中的表达水平不同,其中在叶片中表达水平最高,纤维中的表达水平最低,存在组
织特异性。而且随着盐胁迫强度的增加,VP 家族中不同成员的表达水平发生变化
不同。
I
4 .克隆了棉花GhVP 基因。构建pBI121-Gh VP::GFP 荧光表达载体,采用基因枪技
术转化洋葱内表皮细胞,结果显示 GhVP 基因定位于细胞质膜上。构建
pBI121-Gh VP::GFP 荧光表达载体转化棉花花粉,花粉荧光明显增强,说明
pBI121-Gh VP::GFP 基因可以在棉花中表达,为GhVP 基因在棉花中表达提供依据。
5 .研究了 GhVP 和 GhNHX 基因在棉花上的表达。构建了荧光表达载体
pBI121-Gh VP::GFP,超
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