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玉米WRKY基因启动子的克隆与功能分析论文
1 文献综述
1.1 植物启动子概述
1.1.1 启动子的概念
启动子(promoter)位与基因的上游,是一段提供RNA 聚合酶识别和结合
的DNA 序列。一旦RNA 聚合酶定位并且结合到启动子序列上,即可启动转录
基因的表达首先是该基因5’端启动子序列能否被植物的RNA 聚合酶所识别,
[1]
从而启动基因的转录 。RNA 聚合酶转录过程的开始必须定位并且和启动子结
合,所以使基因表达的启动子是一个重要的顺式作用元件,启动子调控的实质是
它与RNA 聚合酶或者其他的蛋白辅助因子等反式作用元件相互作用的结果。
启动子作为基因的表达调控重要的顺式作用元件,具有下面四个特征:1)
序列特异性。在启动子的基因序列中,一般含有若干个保守序列框,在序列框中,
若碱基序列发生改变,会使得转录启动滞后并且使得转录速度减慢。2)方向性。
启动子具有方向性,在其正反两个方向中,只有一个方向具有启动的功能。3)
位置特性。启动子在所要启动的转录基因上游或者基因内部的前端。4)种属特异
性。通常亲缘关系越相近的两种生物,启动子通用的可能性越大。
1.1.2 启动子的结构
真核生物中,有三种RNA 聚合酶,并因此将这三种RNA 聚合酶作用的启
动子分为三类:类别I启动子、类别Ⅱ启动子、类别Ⅲ启动子。真核生物的启动
子Ⅱ由两大部分组成:核心启动子元件(core promoterelement)和上游启动子元
件 (upstreampromoterelement)。
(1) 核心启动子元件(corepromoterelement)
核心启动子区域包括了启动子必须的转录起始位点和TATA 盒。TATA 盒是
位于转录起始位点上游的一段保守的基因序列,它富含AT 碱基对。TATA 盒有
7对保守的碱基序列:5’-TATA(A/T)A(A/T)-3’,提供RNA 聚合酶Ⅱ的结
合位置,在很多情况下也会影响到基因的转录水平。TATA box是第一个被确定
的RNA 聚合酶Ⅱ的启动子元件,也是一些反式作用因子与DNA 相互作用的位
点之一。植物的启动子的TATA 框是在转录起点的上游约50bp处的一段序列,
富含AT 碱基对,它的保守的序列为TCACTATATATAG。
(2) 上游启动子元件(upstreampromoterelement)
在许多真核基因启动子中,位于转录起始位点上游大约80bp-220bp的序列
都有上游启动子元件,它们可以很大程度上提高基础启动子的转录活性。较为重
要的上游元件有两种:一种是一般上游元件,比如CCAAT 盒和GC 盒,普遍存
在于真核基因启动子中;另一种上游元件是启动子特有的上游元件。
-1-
(3) 其他影响基因表达的调控序列
除启动子外还有一些特定序列能提高基因的转录速率或加工效率,比如增强
子、5’UTR(5’-非翻译序列)、3’UTR(3’-非翻译序列)、Kozak 序列、沉寂子
等。
1.1.3 植物启动子的分类
可以依据不同的标准对启动子进行分类。按启动子来源可分为:原核启动子
和真核启动子;从转录模式上,启动子又可以分为组成型启动子和诱导型启动子。
植物基因工程常其作用方式及功能可分为三类:组成型启动子、诱导型启动
子和组织特异性启动子。
(1) 组成型启动子
组成型启动子能在所有细胞中都能启动基因表达,基因表达的产物具有稳定
性和持续性,基因的表达量随着植物的生长发育不发生明显的变化。研究发现,
[2]
在组成型启动子的转录起点的上游的几百个核昔酸处,有共有序列TGACTG 。
现在被广泛应用的组成型启动子有如下几种:水稻actin 基因启动子(Act1)、花椰
菜花叶病毒CaMv35S启动子、水稻Ubiquntin 基因启动子、章鱼碱合成酶基因(oes)
启动子以及土壤根癌杆菌Ti 质粒的胭脂碱合成酶基因(Nos)启动子。花椰菜花叶
病毒355启动子现在被广泛的应用,它的启动活性强,而且表达量高,所以在双
子叶植物中的应用己经得到人们的认可,但在单子叶植物中,它的调控表达能力
[3,4,5]
较弱 。水稻Actl 启动子也是表达量高、启动性强的组成型启动子,actin 基
因表达
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