以分子动力组学的方法探究嗜盐酶的嗜盐机理 - 华侨大学学报（自然 .pdfVIP

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2017-09-02 发布于天津
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以分子动力组学的方法探究嗜盐酶的嗜盐机理 - 华侨大学学报（自然 .pdf

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以分子动力组学的方法探究嗜盐酶的嗜盐机理 - 华侨大学学报（自然

第卷第期华侨大学学报（自然科学版）３４２Ｖｏｌ．３４Ｎｏ．２　　　　年月（）２０１３３ＪｏｕｒｎａｌｏｆＨｕａｉａｏＵｎｉｖｅｒｓｉｔＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＭａｒ．２０１３　　ｑｙ文章编号：（）１０００５０１３２０１３０２０１６９０７　　以分子动力组学的方法探究嗜盐酶的嗜盐机理王四华，黄可君，张光亚（华侨大学化工学院，福建厦门３６１０２１）摘要：通过分子动力组学的方法，从原子尺度上分析组嗜盐酶及其同源非嗜盐酶的分子动力学特性结果４．　发现：嗜盐酶所形成的盐桥和氢键明显多于非嗜盐酶，嗜盐酶的溶剂可及性表面要小于非嗜盐酶通过比较．嗜盐与非嗜盐的均方根偏差、回旋半径及末端距等参数，发现嗜盐酶的结构较非嗜盐酶更具刚性同时，非嗜．盐酶多个部位的氨基酸残基柔性比嗜盐酶的要大很多研究表明：能形成较多的盐桥、氢键，较小的溶剂可及．性表面和整体结构的刚性，很可能是嗜盐酶在高盐环境中维持其结构稳定的主要原因．关键词：嗜盐酶；非嗜盐酶；动力组学；分子动力学模拟；嗜盐机理　中图分类号：；文献标志码：Ｑ９３７Ｏ６４８．１２１Ａ　　嗜盐菌是一类生活在盐域环境中的微生物，主要生长在盐湖、盐沼、死海和盐场等环境中，Ｋｕｓｈｎｅｒ［］１等将其分为弱嗜盐菌、中度嗜盐菌和极端嗜盐菌嗜盐菌体内的蛋白酶不仅能耐受一定的盐离子强．度，而且必需依靠一定的盐离子强度来维持其结构与功能的稳定对于极端嗜盐菌如嗜盐古生菌，其体．［］－１２内的酶可在盐浓度高达 · 的环境下保持活性和稳定性，而在低盐浓度下，嗜盐古生菌体５．２ｍｏｌＬ［］［］３