种子蛋白质组的研究进展.pdfVIP

植物学通报ChineseBulletinofBotany 2008，25(5)：597—607，WWW．chinbullbotanycorn - 专题介绍- 种子蛋白质组的研究进展 黄荟1I4，姜孝成3程红焱2，宋松泉2 ’中国科学院西双版纳热带植物园，云南勐腊 666303； 中国科学院植物研究所，北京 100093 。湖南师范大学生命科学学院，长沙 410081； 中国科学院研究生院，北京 100049 摘要 蛋白质组学是通过对全套蛋白质动态的研究，来阐明生物体、组织、细胞和亚细胞全部蛋白质的表达模式及功能模 式。大量可用的核苷酸序列信息和灵敏高速的质谱鉴定技术，使得蛋白质组学方法为分析模式植物和农作物的复杂功能开辟 了新的途径。目前，种子蛋白质组研究主要集中在两个方面：一方面是鉴定尽可能多的蛋白，以创建种子特定生命时期的蛋白 质组参照图谱：另一方面主要集中在差异蛋 白质组，通过比较分析不同蛋 白质组，以探明关键功能蛋白。该文综述了近年来种 子蛋白质组的研究进展，内容包括种子发育过程中蛋白质组的变化，与种子休眠／萌发相关的蛋白质组、翻译后修饰蛋白质组、 细胞与亚细胞差异蛋白质组以及环境因子对种子蛋白质组的影响：并对种子蛋 白质组研究的热点问题进行了展望。 关键词 细胞与亚细胞，休眠与萌发，蛋白质组学，翻译后修饰，种子 黄荟，姜孝成，程红焱，宋松泉 (2008)．种子蛋白质组的研究进展．植物学通报 25，597-607 种子是植物繁殖后代的重要方式，是子代植株形成 spectrometry，MS)技术外，被称为第二代蛋白质组学技 的开始。种子从结构和生理上已做好了传播的准备，也 术的各种新型的技术方法有多维蛋 白质鉴定技术 贮藏了足够的养分以供幼苗长成 自养体(Bewleyand (multidimensionalproteinidentificationtechnology， Black，1994)。目前关于种子的形态结构和生理生化的 MudPIT)及包括荧光差异双向电泳 (fluorescence2-D 研究较多，但对于许多重要的内在机理还知之甚少。传 differencegelelectr0phoresis，DIGE)、同位素亲和 统的种子研究方法已经进人 “瓶颈”，急需新的研究思路 标记 (isotope·codedaffinitytags，ICAT)、相对和绝 和方法。蛋白质是生理功能的执行者，是生命现象的直 对定量的同位素标记(isobarictagsforrelativeandab- 接体现者，对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在 solutequantitation，iTRAQ)和细胞培养中氨基酸稳定 生理过程中或逆境条件下的变化机制。蛋白质在种子的 同位素标记(stableisotopelabellingbyaminoacids 形成、发育、萌发直至成苗的过程中都扮演着极其重要 incellculture，SILAC)的定量蛋白质组技术等，它们被 的角色，它为幼苗生长发育提供养料，也调控着种子的各 广泛用于对不同基因型、不同品种、转基因和突变体 种生理生化反应和代谢过程(ShewryandCasey，1999)。 种子的生活史各个阶段 以及种子组织、亚细胞结构和 蛋 白质组 (proteome)最初是由Wilkins和Wiliams 环境对种子影响的蛋白质组研究中(Rossignol，2001： 提出的。它是指一个基因组、一种生物或一种细胞 ／ Rossignoleta1．，2006)。 组织所表达的全套蛋 白质(Wilkins，1996)。蛋白质组 在很多情况下，人们栽培作物的目的是为了获得高 是个动态的概念，它不仅在同一机体的不同组织和细胞 产优质的种子 。因此，种子蛋白质组的研究愈来愈受到 中不同，在同一机体的不同发育阶段也发生变化：机体处 人们的重视 。本文综述了近年来种子蛋白质组的研究 于不同的生理状态，以及在不同外界环境下蛋白质组也 进展，包括种子发育过程中的蛋 白质组、与种子休眠 ／ 不同。除了传统