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科学计算双路并行犐／犗优化方法-计算机学报
第卷第期 计 算 机 学 报
３８ ５
Ｖｏｌ．３８Ｎｏ．５
年月
２０１５５ Ｍａ２０１５
ＣＨＩＮＥＳＥＪＯＵＲＮＡＬＯＦＣＯＭＰＵＴＥＲＳ ｙ
科学计算双路并行／优化方法
犐犗
曹立强莫则尧沈卫超夏芳陈军
（北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京 ）
１０００９４
摘要科学计算数据集由数据和元数据组成一般条件下，数据的尺寸较大，元数据尺寸较小传统的高性能计
． ．
算机并行文件系统可以高效率地读写大块连续数据，但是无法高效率地读写大量较小块的元数据一旦大块数据
．
， ／， ，
和小块元数据两类读写特征混杂在一起元数据将较严重地干扰并行 造成性能的下降为此文中提出数据与
ＩＯ ．
／ ／ ，
元数据分治的双路并行 方法该方法在高层 库中建立内存文件系统与并行文件系统两级存储在存储资
ＩＯ ． ＩＯ
／ ，
源之间并行迁移科学计算元数据一方面降低较频繁读写元数据的 延迟另一方面改变科学计算数据的存储
． ＩＯ
， 、 ／ ，
特征与存储模式从而提高科学计算应用尤其是数据分析与可视化等读入密集型应用的 效率测试表明双
ＩＯ ．
路并行／方法可提高写性能 ，提高读性能 到 倍
ＩＯ ８％１３％ ８９％１．０１．
～
关键词 ／； ／ ； ； ； ／
并行 高层 库性能优化数据格式双路并行
ＩＯ ＩＯ ＩＯ
中图法分类号 号 ／
ＴＰ３０２ 犇犗犐１０．３７２４ＳＰ．Ｊ．１０１６．２０１５．０１０３５
／：
犇狌犪犾犆犺犪狀狀犲犾
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