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使用mst 在天然的生物溶液中测定分子间相互作用
使用MST 在天然的生物溶液中测定分子间相互作用
摘要
在人体内的蛋白互作反应与在体外的情况是不同的。在研究蛋白功能和开发新药的时候这一
点是很重要的。在这篇文章中,我们介绍了一种高效 ,不限缓冲液的方法,即微量热泳动
方法,这种方法可以分析蛋白分子或者小分子在生物液中的相互作用,比如血清或者细胞裂
解液。这种技术以分子的热泳动为基础,提供了分子大小,电话和水化层方面的信息。我们
用免疫学相关系统,包括人体干扰素γ,以及钙调蛋白和钙离子的相互作用验证了这种方法。
小分子抑制剂橡黄素和它的激酶PKA 的亲和力分别在缓冲液和血清中进行测定,结果发现二
者的亲和力在血清中下降了400 倍左右。生物体液对亲和力的影响给予蛋白功能研究更可靠
的结论,有可能促进更多高效的药物开发。
结果
实验方法 实验设置是由红外激光通过红外分色镜被耦合至荧光激发/发射通道中而最终
完成成像(Fig. 1a)。激光通过物镜(此物镜也被用作进行荧光检测)聚集在样品上。这样
就能够在各种微流样品隔室里,比如毛细管或者微流通道里进行热泳动观察。使用 100um
直径的玻璃毛细管,以及500nl 的体积使得消耗的样品量很低,而且有很高的重复性。红外
激光在 25um 的长度范围内产生一个空间上的温度分布。温度与激光功率呈线性增长。在
150ms 后,激光加热与散热达到平衡,得到一个差不多 2-6K 的稳态的温度增加。温度上升
引导了一个空间上的浓度分布,这个是可以根据与荧光染料共价结合的互作分子的荧光变化
观察到的。一般来说,每个蛋白分子的一个伯胺会被标记,所以染料的位置也是呈统计学的
分布。考虑到一个典型的蛋白分子里的赖氨酸数量,我们可以认为标记会影响结合的机率是
很低的。大部分蛋白分子被标记在远离结合位点的位置上,影响结合反应的只是小部分。为
了测量蛋白分子的热泳动过程,我们对初始状态与稳态之间的浓度变化进行测量。所以可以
得到样品的两个图像:在激光加热前的初始状态的图像,显示的是分子的同质均匀分布;第
二个图像是激光加热数秒后的图像(Fig. 1b)。这么短的测量时间是足够的,因为在温度分
布的小空间内的质量扩散是很快的。即使在测量时间内分子扩散很慢,并且没有达到稳态,
浓度分布曲线在数秒后也是可以被辨识的。关闭红外激光加热,导致由于扩散运动引起的初
始同质均匀浓度曲线的回复,从而提供了分子扩散系数的信息。
Figure 1/MST 设置和原理. (a)实验方法. 使用一个额外的二向色镜插入到荧光显微镜中,
加热的红外激光聚集到内径有100um 的石英玻璃毛细管中。荧光样品通过CCD 成像。(b)荧
光图像. 图像通过时间形成。起初,荧光标记分子呈均匀分布。在打开红外激光加热后,分
子在温度梯度场中经历热泳动力,一般会从热区向外扩散。在稳定状态下,分子会通过质量
扩撒达到平衡,建立一个稳态浓度分布曲线。色码表明样品中的相对荧光。(c)稳态曲线. 人
体干扰素γ 在不同浓度的结合抗体(黑体x:0.1 nM,红体+ :80 nM,蓝体# :500 nM )条
件下的稳态分布曲线。分子损耗直接反映了结合复合体部分。
为了研究结合反应,测量实验在不同的结合配体浓度下进行。一般来说,带有荧光标记
的结合分子保持固定浓度不变,未被标记的分子被梯度稀释,直到所有结合位点都达到饱和。
Figure 1c 显示了在不同的特定抗体浓度下,人体干扰素 γ (hIFN-γ)的稳态分布曲线。在
抗体低浓度条件下,曲线反映了未结合蛋白分子的热泳动;在抗体高浓度条件下,曲线反映
了复合物的热泳动。对中间浓度来说,测到的分子损耗是结合和未结合状态的线性叠加:
在方程式(1)中ΔCmeasured 是测量到的损耗,ΔCbound 和ΔCunbound 分别代表结合和未结合状态的
损耗,ƒ是分子在结合状态下的部分。在核心区域的浓度变化可以与梯度稀释的配体分子一
起直接转换成结合曲线。从这些数据中可以确定平衡解离常数K 和可能的协同效应。
d
蛋白分子的相互作用. 蛋白分子之间的特殊互作反应在细胞功能里有一个基本原则,而且对
生物技术应用和免疫抗体实验来说十分重要。接下来我们在几个代表性的实验中应用MST,
来显示它在药物开发或者研究领域,在互作反应研究方面使用的可行性。
首先,我们确定抗原hIFN-γ (17KDa)和它的抗体(120KDa)的亲和力。hIFN-γ 是一个
二聚化的可溶的细胞激素,它对细胞内致病菌的免疫和肿瘤控制很重要。hIFN-γ 用
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