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形成rna诱导的基因沉默复合体
* * 2006年诺贝尔医学奖 演讲人: 魏玮 RNA干扰机制 一 获奖者简介 安德鲁·法尔(Andrew Fire) ·1959年出生于美国加利福尼亚州圣克拉拉县 ·1983年获美国麻省理工学院生物学博士学位 ·现任斯坦福大学斯坦福医学院病理学和遗传学教授 克雷格?梅洛(Craig C. Mello ) ·1960年 出生于美国 ·1990年获得哈佛大学生物学博士学位 ·现任美国哈佛大学马萨诸塞州医学院分子医学教授 二 RNAi 机制 1.RNAi 背景 ● RNA interference 由双链RNA(Double Strand RNA简称dsRNA)指导的,在特定酶参与下,以外源或内源mRNA为降解目标,在转录后水平上使特异性靶基因发生的沉默现象 ● 生物界普遍存在的一种古老而进化的高度保守的生物学现象 ● 存在于从真菌到高等植物、从无脊椎动物到哺乳动物的大多数真核生物中,原核生物暂未发现 2. RNAi的发现 ☆ 1990年,科学家Rich Jorgensen将产生紫色素的基因置于一个强启动子后导入开紫花的矮牵牛中,希望得到紫色更深的花,但结果是:矮牵牛花完全褪色,花瓣变成了白色。当时认为这是导入的基因和其相似的内源基因同时都被抑制,并将之称为协同抑制 ☆ 1995年,康奈尔大学的Su Guo博士在用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现:反义RNA(anti sense RNA)和正义RNA( sense RNA)都阻断了基因的表达 ☆ 1998年,Andrew Fire和Craig Mello将反义RNA和正义RNA同时注射到秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)比单独注射反义RNA诱导基因沉默的效率高10倍 3.RNAi机理 3.1 dsRNA的形成 ◆ 基因组中DNA反向重复序列的转录产物 ◆ DNA同时转录了反义RNA和正义RNA的互相结合 ◆ 病毒RNA 复制中间体 ◆ 以细胞中单链RNA 为模板,由细胞或病毒的RNA 在有关酶的催化下合成dsRNA等 3.2 siRNA(干扰性小RNA small interfering RNA,简称siRNA)的形成 ▲ RNaseIII家族中特异识别双链RNA的一员 ▲ 含有解旋酶活性以及dsRNA结合域和PAZ结构 3.21核酸内切酶Dicer (1)dsRNA在细胞中大量扩增 (2) dsRNA在细胞中达到一定量时,核酸内切酶Dicer识别并与之结合形成酶-dsRNA复合体 (3)核酸内切酶Dicer 对siRNA进行切割,产生21-23nt长的dsRNA小片段,即siRNA 3.22 siRNA形成过程 3.23 siRNA的特征性结构: ※ siRNA 的序列与所作用的靶mRNA 序列具有同源性 ※ siRNA 两条单链末端为5′端磷酸和3′端羟基 ※ 正义链与反义链各有21个碱基,其中19个碱基配对,在每条链的3′端都有2个不配对的碱基(图1)。 图1 siRNA示意图 3.3 RISC的形成和发挥效应 siRNA和核糖核酸酶复合物结合,形成RNA诱导的基因沉默复合体(RNA-induced silencing complex,简称 RISC) 3.32 RISC 蛋白成分 内切核酸酶、外切核酸酶、解旋酶、同源RNA 链搜索活性酶、Argonaute等 3.31 RISC的形成 ☆ Argonaute有一个月牙型的底座由三部分组成,分别为N-端(amino-terminal)、中部(middle)和PIWI区域(PIWI domain)。月牙底座上面有一个PAZ部分,由茎杆结构支撑。Argonature蛋白有一个凹槽贯穿整个蛋白,凹槽内壁带正电有利于与RNA带负电的磷酸骨架结合 3.33 Argonaute蛋白 ☆ RISC的特有成分,被比喻成“切薄片的机器”。 图2?? siRNA引导mRNA被切割的模型 (1) RISC中的siRNA依赖ATP水解释放的能量而解旋,双链转变成单链而使复合体被激活,得到活性RISC。 (2) siRNA解旋后,siRNA单链的3’端伸入PAZ的裂缝中,整个单链沿着PAZ伸展开,同时目的片段mRNA结合于新月型底座。siRNA反义链与mRNA互补区域结合,形成双链 (3) 在离单链siRNA5’端9个碱基处,由RNA酶切割mRNA,阻断RNA的翻译,达到在RNA水平上干扰基因表达的效果 3.33 效应阶段 紫色 正义RNA段 蓝色 反义RNA段 绿色 目标信使RNA 图4 RNAi原理示意图: siRNA 形成后另外作为一种特
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