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＜豬病新知＞ 美國新型豬腸道冠狀病毒病(SECD)發生原因調查 文／財團法人農業科技研究院副研究員 孫豫芬 美國在2013年4月確認首例豬流行性下痢(PED)感染後，病毒隨即迅速傳播至全國各地豬場。美國動植物防疫檢疫署獸醫管理處(APHIS-VS)結合養豬業者及相關專業人士，開始進行新型豬腸道冠狀病毒病(Swine Enteric Coronavirus Disease；SECD)的實驗室診斷、流行病學、數據管理和分析等工作。許多調查和研究目標都試圖釐清疫情爆發的原因與病毒如何進入美國，以及是否還有其他疾病風險可能會以相同路徑進入美國。因此，美國農業部(USDA)在2014年春末組成疫情調查小組(RCG)，推測SECD進入美國的途徑及最可能的情況。 在2013年4至8月期間，有三種新型豬腸道疾病冠狀病毒(SECDv)可能透過相同機制，同時或在數個月內進入美國養豬場。雖然SECDv進入美國可能僅是偶發事件；但若未來沒有實施相關措施，亦不排除此種情況會再發生。調查小組的調查範圍在於新型SECD發生和散播原因探討，其任務為審閱和解讀2013年4月PED開始爆發後的大量資料，並從流行病學角度探討此問題，以更具體解決SECD進入美國的問題；同時評估美國在進口管理的規範，是否有豬隻外來病毒性病原感染之明顯缺口。 美國SECD疫情分析 PED病毒推測在2013年3或4月上旬即進入美國。經國家診斷實驗室的回顧性樣品檢測，確認2013年4月15日在俄亥俄州豬場出現第一指標病例，該病毒基因序列與中國安徽省分離的AH2012病毒株高達99.5%相似性；而第二指標病例幾乎同時發生在印第安納州，仔豬有嚴重下痢和快速死亡，母豬和新女豬出現下痢和食慾不振之情形。自2013年4月PED疫情爆發後，此病毒也快速打破美國許多豬場的生物安全管控防線，其中包括許多豬生殖與呼吸道綜合症(PRRS)清淨豬場。同時，在10天內可從四個不同地理位置的個別豬場，檢測到基因序列完全相同之病毒；但這些豬場之間並無流行病學上的相關性。 豬Delta冠狀病毒(PDCoV)在2014年1月首次有報告。從實驗室回溯樣品之檢測指出，PDCoV在檢出之前已經存在於美國很長一段時間。由於此病毒的毒力較低，所以臨床上並不像PED初期有爆發的疫情；而PDCoV在2013至2014年的流行病學曲線，與PED的疫情也很相似。有學者將不同地理位置所分離的PEDV和PDCoV進行全病毒基因序列親緣鑑定分析，結果發現在病毒的四種結構蛋白中出現幾個開放讀碼框(ORF)，其中棘蛋白(S)、N和M基因檢出具有多樣性。由於PDCoV目前僅有少數病毒株的定序報告，且亞洲很少有PDCoV分離株，因此尚無更詳細的親緣關係文獻發表。 目前將美國檢出的PED病毒株區分成三群，包括Vlasova等人於2014年發表的北美第1群和第2群，以及其他學者發表的S-INDEL群；這些是從S基因序列差異來區別病毒株間的變異，而不是以全病毒做定序比對分析。從基因流行病學研究顯示，美國爆發的PED病毒株和中國在2010至2012年的PED病毒最相似。美國PDCoV病毒株的分析演化和亞洲分離株源自相同祖先；但從全病毒基因演化分析，美國病毒株和2009至2010年從香港家豬分離到的病毒株屬於不同分支。從美國和亞洲PED病毒分支親緣關係的相關性分析，PDCoV和PED病毒分支間的親緣關係是遠親，並分屬在不同的冠狀病毒科(Coronaviridae)─Delta冠狀病毒和Alpha冠狀病毒。 SECD發生原因之調查重點 疫情資訊的分析和彙整是困難且複雜的。在許多疾病的爆發初期，獸醫師或相關人員往往無法即時進行報告彙整和資訊回饋。雖然從目前研究結果尚無發現任何可能的病毒進入途徑，但調查小組的調查分析含括下列重點： 病毒需存活：病毒要從不同國家進入(尤其來自亞洲)，環境和載體基質的狀況需足以讓病毒穩定；或整個傳輸過程需在很短時間內(如空運)。 不同國家的比較：此部分解釋為何SECD疫情發生在美國，而不是加拿大或有相似養豬產業與國際旅客和進口產業的歐盟國家。 從豬場調查：SECD污染源的假設情形，需與目前的疫情調查資料相符。若攜帶SECD病毒的假設物品或人員未曾與牧場接觸或有任何方式鏈結，似乎不可能造成疫情爆發。 病毒傳播路徑：假設情況需能解釋病毒進入的途徑，應包含必要的四階段才能造成感染：(能攜帶SECD病毒的物品或人員，是從已感染的國家或地區進入美國；(病毒在過境到美國時，仍需維持存活和具有傳染力；(病毒在進入美國後，可在很短時間分散到不同地區，2週內就能傳播到至少六個不同地理位置；(病毒必須進入豬場和造成豬感染群。 可合法進口：若假設攜帶SECD病毒的物品可合法進入美國，從美國海關及邊境保衛局(CBP)的數據和APHIS的進口許可證，都可查出從S