DNA条形码在植物系统发育区系学研究中的应用-生物多样性.PDF

生物多样性 2015, 23 (3): 295–296 doi: 10.17520/biods.2015064 Biodiversity Science http: // DNA条形码在植物系统发育区系学研究中的应用 葛学军* ( 中国科学院华南植物园, 广州 510650) Application of DNA barcoding in phylofloristics study * Xuejun Ge South China Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou 510650 达尔文1845年在给虎克的一封信中指出: “地 合, 区系内所有物种的系统发育树即宏系统发育树 理分布这个伟大的主题几乎是生命规律之基石” (mega-phylogeny)的重建, 是深入研究区系起源、演 (Good, 1953) 。探索生物的地理分布格局及其成因是 变的前提和基础。 进化生物学家持续不断的追求之一。植物区系的形 结合系统发育分析探讨生物多样性格局的形 成是植物在一定的自然历史环境中发展演化和时 成和维持机制是当前生物多样性相关学科的研究 空分布的综合反映(吴征镒等, 2010)。除了现代气候 热点和前沿(Donoghue, 2008) 。Faith (1992)创建了系 条件的影响外, 历史过程中可能发生的隔离、分化、 统发育多样性指数(phylogenetic diversity, PD), 并将 扩散和灭绝等进化事件对现代生物地理格局的形 其定义为在有根系统发育树上连接一组分类群的枝 成也有重要影响。植物系统发育包含了物种分化、 长总和。它将系统发育树从图形转变为可量化的数 灭绝、分化时间、物种间亲缘关系等进化信息, 因 值, 从而可对一组物种的进化潜力进行定量研究 此, 植物区系研究只有与植物系统发育结合, 才能 (Faith, 2013) 。系统发育多样性不受物种分类地位变 真正揭示进化历史和生态因素等对现代植物区系 更的影响, 是生物多样性研究的一个里程碑式的指 组成的影响。 数(Winter et al., 2013; Cardoso et al., 2014; Davies, 在早期的植物区系研究中, 主要采用分类学的 2015) 。进入本世纪以来, 系统发育多样性指数促进了 统计和分析来比较不同植物区系间科、属、种的相 系统发育在群落生态学、保护生物学及生物地理学等 似性系数, 并说明其相似程度。物种相似性分析的 研究领域的应用(Faith, 2002, 2015; Graham Fine, 基础是假设每个物种的进化历史都是独立的, 忽略 2008; Cadotte Davies, 2010; Qian et al., 2013a)。 了类群间的系统发育关系。随着分子系统学的兴起, 群落系统发育学(community phylogenetics)在 系统发育分析为评价历史和进化过程对现代生物 研究群落物种组成配置时, 考虑了物种间的系统发 多样性格局的影响提供了重要工具(Ricklefs, 育关系, 可用于评价生态因素(生境过滤和竞争排 2007) 。如果给系统发育树赋予时间和空间的度量, 除)与进化过