后基因组时代研究中兴起的新型学科.docVIP

　　后基因组时代研究中兴起的新型学科 -- 摘 要：蛋白质组学是后基因组时代研究中兴起还不到十年的新型学科,但已应用到生命科学与基础医学研究中的各个领域. 对蛋白质组进行大规模的分析可使我们更加深入了解生物体的结构与功能. 在神经科学研究领域,对于神经突触、受体复合物以及其他的本论文由 .51lunbitsky 等运用该技术检测了人细胞系应对外界信号刺激的信号传导通路相关蛋白因子的酪氨酸残基的磷酸化修饰的变化,并期望在神经信号传导研究中发挥该技术的特殊优势[31 ] . 蛋白质芯片的另一亚类为功能蛋白质芯片,该技术平台可广泛用于检测蛋白质与脂类分子、核酸、小分子类物质以及与其他蛋白分子之间的相互作用[30 ] ,最近这项技术平台已有用于肿瘤发生和神经信号传导研究的报道[32 ,33 ] .蛋白质芯片研究策略的发展得益于全基因组测序计划完成的结果,从而将各个基因的开放阅读框(ORF) 导入一定的重组表达系统并获得大量目的蛋白用于芯片的制作. 另外,合成的多肽也可用于芯片的制作,已有文献报道用这类芯片研究蛋白质磷酸化修本论文由无忧% --1667% .51lunura 等用此方法鉴定了CaM激酶Ⅱ的28 个底物蛋白[41 ] . 同时,质谱依赖的方法可用来定量观测蛋白的磷酸化水平,并研究因磷酸化修饰而导致的蛋白质相互作用模式的改变. 近年来,该类方法还被用于神经病理学的研究. 双向电泳结合免疫学检测和质谱分析技术已有用于研究阿尔茨海默氏病和老年鼠脑蛋白样品相关蛋白质分子的氧化磷酸化和硝化情况[42 ,43 ] . 生理状态下蛋白质酪氨酸残基的硝化状态代表着一种病理特征,与多种神经褪型性疾病的发生相关,如阿尔茨海默氏病和帕金森综合症等. 在Castegna 等人的研究中,从阿尔茨海默氏病人脑蛋白提取物中发现了6 个蛋白质硝化作用的靶标,进而在分子水平上对氧化胁迫涉及该疾病的发生提供了潜在证据[42 ] . 在另一研究中,Soreghan 等研究人员发现活性氧类(ROS) 介导的蛋白质氧化对于衰老相关的神经疾病的发生起着重要作用,并在该类疾病模型的小鼠脑中发现了重要的标志分子,为将来设计相应药物治疗和缓解该类疾病提供了重要的分子水平上的依据[43 ] . 4 　蛋白质组学在神经科学研究中所面临的挑战　　尽管在过去的十年中蛋白质组学相关技术有了很大的发展,并在很多学科研究中发挥了不可替代的作用,并取得相当丰硕的成果,但在神经科学研究领域中的应用还面临着严峻挑战. 最大的问题之一就是蛋白样品的准备. 脑是高度复杂和不均一的,很难保证脑蛋白质组的表达谱不受到其他组分的污染. 较好的想法就是用单一的细胞模型作为材料,建立可单独培养的神经元细胞系和神经元以及星型胶质细胞的原初培养物[5 ,6 ,12 ] . 新近发展的激光显微切割技术可以很好的用于对脑中小细胞群或组织块进行精确分离[44 ] . 但这些蛋白组分中本论文由 .51lunwen.整理提供低丰度的调控蛋白还是很难得到鉴定. 如前所述,蛋白质分子不能像DNA 分子那样可以在体外进行无限制循环扩增,因此提高蛋白质缉学分析和鉴定技术的灵敏度是一个很好的策略. 特别 --是当这些技术用于临床时,组织样品更是珍贵和有限. 另外,在处理脑蛋白样品过程中很难保证蛋白样品不被降解,从而使结果出现假阳性和假阴性. 这些不仅是神经科学研究所面临的问题,其他学科也同样如此[2 ] . 挑战之二在于蛋白质组学研究所产生的大量数据还没有配套发展的相关生物信息学工具进行信息挖掘和处理,殊不知这对于阐述神经相关蛋白质分子的功能是非常重要的. 大量蛋白质组学研究数据的产生,需要相关的工具对其进行整合以及建立相关数据库进行存储,并公之与众,使国际上大小实验室尽快达到数据共享和交流. 因此建议神经科学及其他学科科研工能够象基因组测序那样将自己的数据与别人共享,甚至包括实验操作方法的共享和标准化,从而以全球化的合作精神尽快的搞清这些神经相关蛋白质分子的相互作用网络、亚细胞定位,以及在神经发生中所扮演的角色[2 ] . 哺乳动物神经元蛋白质相互作用数据库的组建就是一个很好的例子,其他的神经生物学信息,如基因组的--M,Oda Y,et al. Identification of activity2regulated proteins in the postsynaptic density fraction [J ] . Genes Cells ,2002 ,7 :187 —197. [11 ] 　Li K A ,et al. A roteomic approach to rapidly elucidate oligodendrocyte2associated proteins expressed in