河南省2010年肠道病毒EV71型分离株全基因组序列分析.pdfVIP

JournalofZhengzhouUniversity(MedicalSciences) Sep． 2011 Vo1．46 No．5 ·699 · 河南省 2010年肠道病毒 EV71型分离株全基 因组序列分析术 李幸乐，许玉玲，黄学勇，陈豪敏，许汴利 河南省疾病预防控制 中心传染病所 郑州 450016 #通讯作者 ，男 ，1958年 3月生 ，硕士 ，主任 医师 ，研究方向：流行病与寄生虫病 ，E—mail：xubl@hncdc．eon1．en 灭键词 手足 口病 ；肠道病毒 7l型 ；测序 ；同源性分析 中图分类号 Rl83．4 摘要 目的：了解 2010年河南省流行的肠道病毒 (EV)71型基 因特征 。方法 ：筛选 2010年河南省分离的 EV71型病毒侏 1株 (EV71／Henan／DC／2010)，进行全基 因组序列测定和基 凶进化特性分析。结果 ：EV71／Henan／ DC／2010与其他 EV71病毒株相 比，编码 区无核苷酸的缺失或插入 ，5’UTR区和3’UTR 长度和序列有一定差异 。 核苷酸同源性 比较显示 ，EV71／Henan／DC／2010与2008年北京暴发流行株 同源性最高 (99．2％)，与安徽阜 阳暴发 流行株和河南省暴发流行株均具有很高的同源件 (98．1％和99．1％)；与 EV7l各亚型代表株 的比较结果显示 ，除 VP3区以外 ，EV71／Henan／DC／2010各 区均 与 c4亚 型代 表 株 同源 性 最 高；氨基 酸 同源性 比较结 果 示 ，EV71／ Henan／DC／20l0夫多数核苷酸变异属无义突变 ，相应氨基酸并未随之发 改变。根据 VPI区基因序列构建遗传进 化分析树显永 ，EV71／Henan／DC／2010 c4亚型同属一个分支。结论 ：EV71／Henan／DC／2010与 2008年北京 EV71 流行株亲缘关系最为接近，同属于 C4IE型 。与我省及我围既往流行毒株相 比，未发生大 的变异 。 CompletesequenceanalysisofEnterovirus71strainfrom afatalcaseof hand-·foot—m·outhdiseaseduringanepidemicofHenanprovincein2010 LIXingle，XU Yuling，HUANG Xueyong，CHEN Haomin，XU Bianli InfectiousDiseaseInstitute，HenanProvincialCenterforDiseaseControlandPrevention，Zhengzhou 450016 Key words hand—foot—mouthdisease；Enterovirus71；se,quencing；homology analysis Abstract Aim：ToinvestigatethegeneticcharacteristicsofEnterovirus71(EV71)circulatingstrainsofHenanprov— ineein2010．Methods：TheEV7Istrainisolatedfrom afataleaseothand—foot—mouthdiseaseduringanepidemicofHenan in2010WaSchosen．ItscompletegenomeWaSsequencedand analyzed comparatively．Results：Theresultsshowed that EV71／lfenan／DC／2010 hadn()insertionnldeletiondetecte~1inthecodingregionbutseveralinsertionsanddeletionsin5’ and3’UFR．PhylogeneticanalysisofEV71／Henan／DC／2010 and referencestrainsshowed ithad thehighestnuelyeotide homohgywith2008BeijingepidemiestrainFJ6