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酒泉地区婴幼儿腹泻轮状病毒感染及其型别探究
酒泉地区婴幼儿腹泻轮状病毒感染及其型别探究摘 要 目的:通过分子流行病学调查,研究酒泉地区婴幼儿轮状病毒(RV)腹泻的分型特点。方法:采用酶联免疫吸附试验(ELISA)和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),对2001年11月~2002年12月酒泉地区收集的324例婴幼儿腹泻粪便标本中的204份进行轮状病毒病原检测,并对阳性标本进行分型。结果:ELISA法RV阳性率为54.9%,阳性率与性别无关。不同年龄段的感染率以7~18个月年龄段最高,但各年龄段间差异无显著性意义。不同月份的感染率差异具有显著性意义,发病高峰在2001年11、12月份和2002年10、11月份。在ELISA阳性标本中RT-PCR法检出G3者50例,G1者16例、G2者6例,G9者2例,G3与G1混合感染6例,G3与G2混合感染2例,30例未能分型。G分型阳性标本中检出P[8]型24例,P[4]型14例,未发现P[6]、P[9]、P[10]。结论:轮状病毒是酒泉地区婴幼儿非细菌性腹泻的主要病原,其流行的主要血清型为G3型及G1型。本次研究结果从分子水平初步揭示了酒泉地区轮状病毒的流行情况,为轮状病毒疫苗在该地区的应用提供了流行病学资料。
关键词 腹泻 婴幼儿 轮状病毒 分子流行病学 基因型
资料和方法
2001年11月~2002年12月共采集酒泉市人民医院儿科门诊和住院部婴幼儿腹泻粪便标本324例,置-70℃保存备用。采用SPSS 11.0软件随机抽样选取204例标本进行检测。
用ELISA法检测RV抗原,采用IDEIATM Rotavirus试剂盒,购自英国DakoCytomation Ltd,按说明书操作。
用RT-PCR法对RV病毒株进行血清株与基因型的鉴定,Taq DNA聚合酶和AMV逆转录酶购自美国Promega Corporation;RNA酶抑制剂(RNasin)购自宝生物工程(大连)有限公司;TRIZOL购自Molecular Research Center Inc.;dNTPs购自sbs赛百盛公司;DNA Maker DL 2,000购自宝生物工程(大连)有限公司。采用PTC-100TM PCR仪(美国MJ RESEARCH公司)进行PCR反应。用TRIZOL提取RV核酸。先逆转录合成病毒cDNA,后巢式PCR对RV标本进行分型,方法见文献[1]。
每批分别用已测序证实的粪便标本作为阳性和阴性对照。
统计学方法:采用SPSS 11.0进行统计,计量资料用均数±标准差表示,两组比较采用非配对t检验,计数资料采用X2检验。
结 果
RV腹泻的年龄分布:本研究共采集酒泉市人民医院就诊婴幼儿腹泻粪便标本324例,电脑随机抽样选取204例标本(年龄11.28±7.76个月)进行检测,ELISA法检测RV阳性112例,阳性率为54.9%。其中住院部患儿34例,门诊78例;男68例(年龄11.46±7.54个月),女41例(年龄11.49±6.52个月),经非配对t检验显示两组间年龄差异无显著性意义(P0.05),经X2检验显示RV阳性率也与性别无关(P0.05)。在所检出的112份RV阳性标本中,RV腹泻年龄范围2~24个月,平均11.16±7.21个月;在不同年龄段中以7~18个月年龄段RV阳性率最高,为62.07%~72.73%,但经Pearson Chi-square检验显示不同年龄段间的阳性率差异无显著性意义 (P0.05)。
RV腹泻的流行季节:从连续13个月收集的204例腹泻患儿每月轮状病毒阳性检出率可见,酒泉地区婴幼儿轮状病毒腹泻全年均有发病,经X2检验显示不同月份的阳性检出率差异具有显著性意义 (P0.01),发病高峰在2001年11、12月份(分别为79.17%和83.33%)和2002年10、11月份(分别为72.22%和77.78%)。在RV阳性标本中,以上月份所占比率亦最高。
VP7型别:112例轮状病毒抗原阳性标本中再进行RT-PCR法检测VP7 G1-G4、G9 5个血清型,能用后巢式PCR确定型别的共82例(73.21%)。其中G3型50例(44.64%),G1型16例(14.29%),G2型6例(5.36%), G9型2例(1.78%),未发现G4型。混合感染者8例(7.14%),分别为:G1+G3 6例,G2+G3 2例。另外有30例(26.79%)未能用现有引物分型。
VP4型别:对VP7分型阳性标本随机抽样选取53份进行VP4分型,检测P[4]、P[6]、P[8]、P[9]、P[10] 5个基因型,能确定VP4基因型别的共38例,占71.7%,其中检出P[8]型24例(45.28%),P[4]型14例(26.42%),未发现P[6]、P[9]、
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