不同统计遗传模型QTL定位方法应用效果的模拟比较.pdfVIP

ACTAAGRoNoMIcASINICA 作物学报 2010，3“7)：1100-1107 ISSN TSHPA9 0496—3490；CODEN DoI：10．3724／SP．J．1006．2010．01100 不同统计遗传模型QTL定位方法应用效果的模拟比较 苏成付 赵团结 盖钧镒‘ 南京农业大学大豆研究所／国家大豆改良中心／作物遗传与种质创新周家重点实验室，江苏南京210095 摘 要：分子遗传和数量遗传的结合，发展了QTL定位研究。随着定位方法与软件的建立和完善，QTL定位的研究 越来越多。准确定位的QTL可用于分子标记辅助选择和图位克隆，而假阳性QTL将误导定位信息的应用。本文分 析了迄今主要定位方法(软件)对于各种遗传模型数据的适用性。应用计算机模拟4类遗传模型不同的重组自交系群 应；第四类包含加性、上位性互作QTL和QTL与环境互作效应。每类按模拟QTL个数不同设两种情况，共分为8 种数据模型(下称M-l～M-8)。选用WinQTLCart2．5的复合区间作图(下称CIM)、多区间作图前进搜索(MIMF)、多区 5．0的多QTL模型(MQM)以及 间作图回归前进选择(MIMR)、IciMapping2．0的完备复合区间作图(ICIM)、MapQTL QTLnetwork 型；只有MCIM适于检测所有4类遗传模型；因而不同遗传模型数据的最适合检测程序不同。南于未知实际数据的 遗传模型，应采用在复杂模型程序，如QTLnetwork2．0，扫描基础上的多模型QTL定位策略，对所获模型用相应模 型软件进行验证。 关键词：QTL定位；遗传模型；定位程序；定位方法与数据模型的适配性 Simulation ofEffectiveness Proceduresof Comparisons amongQTLMapping DifferentStatisticalGeneticModels su GAIJun．Yi‘ Tuan．Jie，and Cheng．Fu，ZHAO Research Centerfor for Soybean Genetics Soybean Institute，NanjingAgriculturalUniversity／National Improvement／NationalKeyLaboratoryCrop and 210095，China GermplasmEnhancement,Nanjing has basedonthe and ofmolecularand Abstract：OTLmappingemerged developmentintegration geneticsquantitativegenetics． withtheestablishmentand of numberofstudiesof invari． great Along improvementQTLmappingprocedures．a QTLmapping have beusedfor OUS beencarried detectedwith can marker-assistedselectionand cropspecies out．QTLs highaccuracy the are