Asia 1型口蹄疫病毒VP1蛋白进化踪迹分析.pdfVIP

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Asia 1型口蹄疫病毒VP1蛋白进化踪迹分析.pdf

第36卷第8期 中国预防兽医学报 V01.36.No.8 2014年8月 ChineseJournalofPreventive Medicine Veterinary Aug.2014 doi:10.3969/j.issn.1008—0589.2014.08.08 Asia 1型口蹄疫病毒VPl蛋白进化踪迹分析 牛银杰,王靖飞+ (中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150001) 摘 要:为预测口蹄疫病毒(FMDV)VPl蛋白的重要功能残基,本研究利用进化踪迹及蛋白结构同源建模等 方法对9l株Asia 年~2006年分离株处于另一个分支,命名为E分支。以10分区分析进化树,共34个组特异残基,其中.加S、 关;B、C、D和E 用界面,可能对病毒的装配具有重要作用。本研究结果为FMDV的vPl功能研究提供了参考数据。 关键词:Asia 1型口蹄疫病毒;VPl蛋白;踪迹进化分析;同源建模 中图分类号:$852.65 文献标识码:A trace oftheVP1 of Evolutionaryanalysis protein foot-and—mouthdiseasevirus Asia1 serotype NIU Yin-jie,WANGJing·fei‘ of ResearchInstitute (StateKeyLaboratoryVeterinaryBiotechnology,Harbin Veterinary Chinese of 15000 AcademyAgriculturalSciences,Harbin1,China) Abstract:To functionalresiduesinVPl offoot—and—mouth amino disease acid predictimportant protein virus(FMDV),VPl of1 9 Asialstrainswere traceand methods.The sequencesserotype analyzed byusingevolutionaryproteinhomologymodeling resultsshowedthat isolates to mostofthe the classificationof D newbranch belongedprevious

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