16S rRNA基因的PCR-DGGE技术分析茶尺蠖幼虫肠道细菌种群结构及多样性.pdf

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第31卷 第6期 江 西 科 学 Vo1.3lNo.6 2013年 l2月 JIANGXI SCIENCE Dec.20l3 文章编号:100l一3679(2013)06—0759—06 ● 16SrRNA基 因的PCR—DGGE技术分析 茶尺蠖幼虫肠道细菌种群结构及多样性 靳 亮 ,王金 昌 ,王洪秀2,张贱根。,杨 罡 ,靳海燕 (1.江西省科学院微生物研究所 ,江西 南昌330029;2.江西省农业科学院农业应用微生物研究所 ,江西 南昌330200; 3.江西省蚕桑茶叶研究所,江西 南昌330202;4.山东省新泰市羊流镇杨家庄小学 ,山东 新泰271200) 摘要:利用 16SrRNA的PCR.DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术分析研究了茶尺蠖肠道内细菌的种类与多样 性。通过对 16SrRNA序列分析,从茶尺蠖野外种群肠道 中鉴定了l1种细菌,这些细菌分属于沃尔巴克氏菌 (Wolbachia)、肠杆菌属(Enterobacter)、沙雷氏茵属 (Serratia)、梭菌属 (Clostridium)、肠球菌属 (Enterococcus)、暂 定类群EO1;其中以肠杆菌、沃尔巴克氏菌、沙雷氏菌属最为常见。另外,也鉴定了一种茶树叶绿体上的16S rRNA基因。茶尺蠖幼虫体 内的共生茵多样性分析结果,将会为害虫综合治理提供一奈全新的探索途径。 关键词:茶尺蠖;肠道细菌;16SrRNA序列;变性梯度凝胶 电泳;多样性 中图分类号:Q968.1 文献标识码 :A BacterialCommunityinM idgutsofEctropicoblique LarvaebyPCR—DGGE and 16SrRNA GeneLibraryAnalysis JINLiang ,WANGJin—chang ,WANG、Hong.xiu ,ZHANGJian—gen ,YANGGang,JIN Hal—yan (1.InstituteofMicrobiology,JiangxiAcademyofSciences,JiangxiNanchang330029PRC; 2.InstituteofAgriculturalAppliedMicrobioloyg , JiangxiAgriculturalAcademyofSciences,JiangxiNanchang330200PRC; 3.InstituteofSericuhureandTea,JiangxiNanchang330202PRC; 4.YangliuTown,YangjiazhuangPrimarySchool,ShandongXintai271200PRC) Abstract:BacterialcommunityinmidgutsofEctropicobliquelarvaewerestudiedbyPCR—DGGEand 16SrRNA genelibraryanalysis.By16SrRNA V3regiongeneDGGEmethod,elevendistinctbands wereobtainedfrom 16SrDNA amplificons.Thebandswerepurified,sequenced.Thesequenceswere alignedwithGenBankdatabaseandshowedthattheywerebelongedto6differentgeneraofbacteria. PhylogeneticanalysisshowedthatthesequencesofbacteriabelongedtotheWolbachia,Enterobacter,

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