012第十二章 转座子.pptVIP

第十二章 微生物的转座子 介绍 R. A. Emerson(1914）在研究玉米果皮色素遗传时，发现一种特殊的突变类型—花斑果皮。这种突变与一般的突变不同，能够在籽粒发育过程中，发生多次回复突变（reversional mutation),从而产生宽窄不同，红色与白色相间的条纹。各籽粒之间斑纹的大小和多少变化很大。Emerson意识到这种花斑条纹的产生在于突变基因的不稳定性，但他并不明白是什么原因造成这种不稳定突变。 30年代，M. M. Rhoades（1938）在研究玉米糊粉层色素遗传时，首次报道一个基因的遗传不稳定性受到另外一个独立基因的控制。他发现，与籽粒糊粉层色素产生有关的a1基因，在另一个独立基因dt处于隐性状态时，遗传是稳定的，糊粉层不产生色素，但在显性基因Dt存在时，就能产生频率不等的回复突变，即由a1突变为A1。具有A1的糊粉层细胞，能够产生色素，所以整个籽粒的糊粉层，表现为在无色背景上分布着许多大小不等的有色斑点。Rhoades把这个引起a：遗传不稳定的基因称为产生斑点（dotted）基因。 40年代初，McClintock开始研究玉米花斑糊粉层和植株色素产生的遗传基础。她发现色素的变化与一系列染色体重组有关。她特别对染色单体的“断裂一融合一桥”在细胞分裂中周期性循环的细胞学现象发生兴趣。她观察到染色体的断裂或解离（dissociation）有一个特定的位点，称作Ds。但一Ds并不能自行断裂，它受一个激活因子Ac(activator）所控制。Ac可以像普通基因一样进行传递，但有时表现很特殊，可以离开原座位，运动到同一条染色体或者不同染色体的另一个座位。Ds也能运动，不过只有在Ac存在时才能发生。 40年代初，Barbara McClintock (1902-1992)发现玉米基因组中存在可在不同区域转移的控制元件，命名为控制因子（Controlling element）或转座子（Transposable element）。 随后在果蝇中发现，但未引起注意。 60年代末，分子水平上证实E.coli（大肠杆菌）存在转座子，引起了科学家的注意。 目前认为，在原核、真核生物的基因组中均存在转座子，包括人类。 根据转座因子的转座机理，将转座因子分为两类 DNA转座子（DNA transposon），其转座过程是从DNA-DNA, 反转座子（retrotransposon），转座过程是以RNA为中间体，即从DNA-RNA-DNA转座 转座子的共同遗传特性 1、转座子插入某个基因之中或附近，会降低或抑制基因的表达。 2、转座子转座后，在转座子两端产生短的正向重复序列。 3、转座子的一部分序列可以转录mRNA，其编码产物有些（转座酶）与转座有关。 4、大多数转座子右端有AATAAA结构，它与mRNA的poly(A)化有关。 5、同一种生物基因组中可能存在多种转座子。如标准E.coli菌株中有8个IS1、5个IS2和5个IS3。 6、有些转座子为一种复合结构，由2个或2个以上的不同转座子组成。 第一节 细菌的转座子 细菌中可转座的遗传因子大致可分为四类： 插人序列(insertion sequence, IS) 转座子(transposon, Tn） 接合型转座子 温和性噬菌体（如Mu, D108） 一、插入序列（ Insertion sequence,IS） 最早被鉴定的转座子是细菌操纵子中的自主插入序列，它的插入阻止插入部位基因的转录和/或翻译。 从E.coli半乳糖操纵子中鉴定出来。 最简单的转座子称为插入序列，插入序列长度为0.7-2.5 kb 。 IS元件是细菌染色体和质粒的正常组成部分，是独立的结构单位，每个元件只编码为自身转座所需要的蛋白质。 IS元件结构 反向末端重复（IR）+转座酶基因。 IS元件结构特性 IS元件两末端为短的（10－40bp ）反向末端重复（Inverted Terminal Repeats, IR），与IS切割和DNA链转移有关。 IS元件的中间（两IR之间）为编码转座所需的转座酶（Transposanase，TnP）的DNA序列，转座酶负责识别切割转座子的两端以及在靶位点造成切口。 末端的IR总是和很短的（3－9bp）正向重复序列连接。正向重复序列通常为受体DNA的靶位点。 对一特定的IS元件，靶位点长度和结构是恒定的。 Insertion sequence elements are the simplest transposable elements.Inverted repeats (IR): similar but not identical nucleotide sequence(imperfect palindrome), recognition site