松墨天牛铁蛋白重链相似物的cdna克隆及生物信息学-广东农业科学.pdfVIP

广东农业科学 2014 年第 16 期 147 松墨天牛铁蛋白重链相似物的cDNA 克隆及生物信息学分析 罗淋淋 吴华俊 林 同 华南农业大学林学院袁广东 广州 510642冤 摘要 昆虫铁蛋白 ferritin 冤由两个亚基组成袁类似于脊椎动物铁蛋白的重链和轻链遥 从松墨天牛 Monoc hamus alte rnatus)c DNA 文库 筛选出fe rritin 基因的重链同源物 (HCH) c DNA 序列袁其开放阅读框 (ORF) 长 669 bp 袁编码 222 个氨基酸袁命名为 Mafer 袁GenBank 登录号为 KJ 872588 袁该序列推测的蛋白分子质量为 25.8 ku 袁等电点为 5.72遥 预 测的松墨天牛 ferritin 信号肽长度为 18 个氨基酸残基袁在 5忆 非编码区没发现铁反应元件 IRE冤袁N 末端有保守的半 胱氨酸袁符合脊椎动物重链特点遥 相似性比对显示袁松墨天牛ferritin 与光肩星天牛 A nop lophora glab ripe nnis 冤和桑天 牛 A p riona ge rmari冤ferritin 的相似性分别为 93% 和 69% 曰系统进化树分析显示袁松墨天牛与光肩星天在同一分支 袁 与黑腹果蝇 Drosop hila me lanogas ter 冤亲缘关系较远遥 关键词 松墨天牛曰 铁蛋白曰 重链同源物 HCH 冤 中图分类号 S763.38 曰Q785 文献标识码 A 文章编号 1004-874X 2014 冤16-0147-04 cDNA cloning and bioinformatics of a ferritin heavy chain homologue from beetle, Monochamus alternatus LUO Lin-lin, WU Hua-j un, LIN Tong (College of Fore s try , South China A gric ultural Univ e rs ity, G uangz hou 510642, China) Abstract: Insect ferritin is composed of two subunits, w hich are similar to heavy and light chains of vertebrate ferritins. A heavy chain homologue (HCH) cDNA of Monoc hamus alte rnatus, designated as Mafer (GenBank: KJ 872588) was obtained from a previously constructed DNA library. The open reading frame of Mafer is 669 bp in length, encoding 222 amino acid residues w ith calculated molecular mass of 25.8 ku and isoelectric point of 5.72. Among the predicted Mafer protein sequence, a 18 amino acid signal