七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞cDNA文库构建及生物信息学分析.pdfVIP

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七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞cDNA文库构建及生物信息学分析.pdf

第33卷第2期 辽宁师范大学学报(自然科学版) V01.33NO.2 of 2010年6月 Journal Normal ScienceEdition) Jun. 2010 Liaoning University(Natural 文章编号:1000-1735(2010)02—0237—07 ia(Lampetra 张 宁1’2, 刘 欣2”, 孙 晶2, 刘岑洁2, 陈 操2, 李 竞2, 芦 静2, 刘慧玲2, 李庆伟2 (1.辽宁师范大学科研处,辽宁大连116029;2.辽宁师范大学海洋生物功能基因及蛋白质组学研究所,辽宁大连116029; 3.辽宁师范大学城市与环境学院,辽宁大连116029) 摘要:以复合免疫日本七鳃鳗(Lampetrajaponica)外周血中分离的单个核白细胞为材料,构建库容量为 4.5X 106pfu·mL-1的eDNA文库,随机挑选单克隆菌落测序共得到10500条有效ESTs(expressedsequencetags)序 列.经PHRAP软件对序列拼接组装后得到3382个转录本.其中有1080个重叠群和2302个单一序列,有59.08% 的转本录在NCBI数据库中搜索到同源序列.运用Blast2GO软件进行GeneOntology注释,分别有27.47%、25.20% 和1o.01%的转录本参与细胞生理、代谢和生物调节等生物学途径1分别有48.43%、22.10%和lO.69%的转录本起到 结合,催化和结构分子活性等分子功能.统计数据显示,与细胞自身基因转录、蛋白质合成及转运等生命过程密切相关 的基因如真核转录延长因子,反转录酶、核糖体蛋白、腺苷酸转运体、细胞色素C氧化酶和热体克蛋白等在血液白细 胞群中大量表达.另外,与固有免疫密切相关的白细胞衍生趋化因子、抵抗素、颗粒体蛋白等表达量相对较高。说明固 有免疫系统在七鳃鳗感染初期的免疫防卫方面起着主要作用. 关键词:日本七鳃鳗;类淋巴细胞;EST;分子标识;发育分化 文献标识码:A 中图分类号:Q811.4;Q959.392 长期以来,有关适应性免疫的起源与进化问题一直是人们研究的热点.适应性免疫是通过淋巴细 胞表达特异性受体来识别外界抗原的,淋巴细胞作为一类特殊的具有免疫活性的细胞,其在进化过程 出现的具体时间目前尚存在争议.以前人们普遍认为适应性免疫系统起源于硬骨鱼类[1],但随着研究的 不断深入,人们发现以七鳃鳗和盲鳗为代表的无颌类脊椎动物处在进化出适应性免疫系统的边缘,无 颌类脊椎动物在一定范围内存在适应性免疫的现象和多种参与适应性免疫相关的免疫因子,这可能提 供揭示适应性免疫系统起源演化的关键线索[2]. japonica)血液内存在形态上相似于有 20世纪80年代初期Fujii等发现了日本七鳃鳗(Lampetra 颌类淋巴细胞的类淋巴细胞[3].在无颌类脊椎动物中,虽然尚未发现胸腺、脾脏、淋巴结等免疫组织, 但在盲鳗消化道的固有层组织及海七鳃鳗(Petromyzonmarinus)幼虫——沙隐虫的褶皱前肠及肾褶 皱,变形后期七鳃鳗的脊椎弓和鳃囊附近的造血组织周围发现有小类淋巴细胞集聚[4。5].Shintani等发 现日本七鳃鳗类淋巴细胞存在PU.1/Spi—B这类在高等脊椎动物淋巴细胞中特异表达的基因,从分子 水平上验证了淋巴细胞在无颌类脊椎动物中存在的前体形式[6].虽然在元颌类脊椎动物类淋巴细胞中 证明在无颌类的免疫系统中存在T、B淋巴细胞表面抗原识别受体的重组机制,说明其类淋巴细胞尚未 完成成熟T、B淋巴细胞的进化. 美国阿拉巴马大学的Cooper团队对海七鳃鳗(Petromyzonmarinus)所含有的脊椎动物免疫系统 的原始元素进行新的搜索,发现了一类新型的富含亮氨酸(LRR)重复序列的可变淋巴细胞受体 收穑日期:2010—03-18 2008T103) 作者简介:张宁(1982-)。男,辽宁营口

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