作用于秋水仙碱位点的微管蛋白抑制剂的结合模式研究与结构模型的构建.pdfVIP

2008年第66卷 化学学报 V01．66．2008 第14期．1735～1739 ACTACHIMICASlNICA No．14．1735～1739 ·研究论文· 作用于秋水仙碱位点的微管蛋白抑制剂的结合模式 研究与结构模型的构建 李耀武 周有骏术 朱驹水 郑灿辉 陈 军 盛春泉 吕加国 唐 辉 栗亚男 张 珏 (第二军医大学药学院药物化学教研室上海200433) 摘要采用对接的方法建立了秋水仙碱位点抑制剂与微管蛋白的结合模式，并构建了其结构模型．结果表明：抑制剂 抑制剂的结合构象，将抑制剂的结构分为A，B以及AB问的桥连三个部分，从而建立了由A部分中的疏水中心H1、氢 键受体Al，B部分中的疏水中心H2、疏水基团H3和极性原子P以及桥连结构中的氢键受体A2组成的结构模型．并 指出Hl与H2对活性的影响因素分别为疏水基团的体积和平面特征，而桥连部分则应以刚性的形式保证AB处于桥连 的同侧(即顺式构象)．还提出在A2与100p区之间存在一个的潜在氢键受体A3．研究结果为设计新型小分子微管蛋白 抑制剂提供指导． 关键词微管蛋白；秋水仙碱；对接；结合模式；结构模型 Onthe ModeSoftheCoIchicine-SiteInhibitorSand Study Binding COnstructjOnOfThejrStruCturaIMOdeI U，Yao—WuZHOU，You—Jun木ZHU，Ju木ZHENG，Can—HuiCHEN，Jun SHENG，Chun—QuanLU，Jia—GuoTANG，HuiLI，Ya—NanZHANG，Jue G“口加尺。础 200433，(协i，m) SJ搬胛g，缎f AbstI翟ct modesofthecolchicine—siteillllibitors a11d Bydoc幻ngsimulation，thebindin2 with伊cubulin meirstructuralmodelwereconstn】cted．Theresultsshowedthatmeinhibitors onme mainlydependedhy— interactionswitllme I and ont11e witll II，ajld a—Thr“6， drophobic hydrophobicpockets hydrogen．bonds di— a．Val”1 totheir confo肌ations，thestnJcturesofmeinhibitorswere and∥．Cys…．Accordingbinding videdintomree A，Bandme betweenthem．ThestmctIlralmodelofme parts，n锄ely bridge