未来海洋微生物功能基因研究的若干关键技术研究.pdfVIP

福建凌日‘ 第三届海洋生物高技术论坛 2005．08．19-23 未来海洋(微)生物功能基因研究的若干关键技术+ 5 张治洲‘，半1’3’4李志勇2白林泉，“3樊春海，5胡钧131 上海交通大学生命科学技术学院BIO—X中心1和海洋生物技术研究室2 上海系统生物学研究所3 上海，邮编200030 天津科技大学泰达开发区食品与生物技术学院系统生物技术和生物信息学研究室4 天津，邮编300457 中国科学院上海应用物理研究所纳米生物医药研究室5上海，邮编201800 摘要：海洋生物研究的一个瓶颈是生物材料的缺乏，该问题在未来5到10年内估计只能解决 一小部分．由于后基因组时代的许多研究是以基因组或部分基因组序列为起点，如果能在基 因猎取技术上技高一筹，将可以部分克服海洋生物学研究的原料缺乏问题和自主知识产权的 获取．基因技术包括若干关键技术，在未来5年内我们将在专利技术基础上集中力量发展面向 全基因组的全新扩增技术和后续的新一代表达和筛选技术．我们的专利技术同样适用于海洋 微生物技术的研究开发．我们的技术将在海绵功能基因研究上首先加以利用． 关键词：基因功能研究全基因组扩增 l前言 海洋生物种类1卜常繁多，但是大部分在相当时问内尚不能解决高技术研究对其数景的需 要景问题。这是海洋生物技术研究的最基本的一个“国情”。所以我们的许多研究策略必须建 立在这个幽情之上。相信在未来的5到lO年内只能解决该问题的一小部分．为了应对这个形 势，国内外考虑的许多策略都是类似的，这种情况下就要看谁的研究投入大和研究速度快， 谁就更可能会早出成绩。 国际上对海洋生物技术的研究的投入相对虽然很大，但是仍然处。J二功能基因研究的初级 阶段。在许多／c『面我们与幽际I司行基本{!c7：J：I刊一起跑线上。为了应对这个形势，我们的策略 是：幽际上正在做或很快要做的研究，我们需要加大研究力度：同时我们也要有一些超前考 虑，包括5年以后幽内外可能需要的海洋生物技术是什么，可以提前组织研究力景进行攻关； 总体L讲幽际上技术研究一一直比我们快，我们一般是使用幽际上现有I，I勺技术，但是幽际上二目 前已经发展的技术还远远不能满足后基蚓组时代功能研究的需要．下面以功能基冈研究为例 重点说明． +因家l商新技术发腱汁訇J(863)(2003AA226011)和f：海市皋础研究重点项目(02JCl4029)及教育部基础研 学技术学院BIO—X生命科学研究中心，200030 425 摄建In 第三届海洋生物育技术论坛 2005．08．19-23 2功能基因研究技术 功能基因研究一般需要下面几个技术： 1．基|大J的克隆和砸克隆： 2．基网的表达和蛋白产物鉴定； 3．重组蛋白或短肽的高表达体系的建立和产物纯化； 4．蛋白异构体和翻译后加T修饰的鉴定； 5． 基冈定点突变和突变蛋白产物的功能鉴定； 6．对二J二功能未知的基因需要通过基阂的突变＼缺失＼过度表达kRNA干涉等方法在细胞系或动 物品系中结合基I犬1芯片等高通景技术找到该基冈的功能线索． 7．该基因在细胞信号通路中的位置鉴定；等等； 上述常用技术在应用到海洋生物的研究时将遇到不同程度的困难．或者说这些技术只能 解决一部分海洋生物功能基因的研究问题．比如，某些特殊环境下的海洋生物其基阕组在序列 结构上可能与陆地有很大不同，一般的基洲扩增技术将不能很好地完成大部分基闪克隆的]二 作；再比如，海洋生物的某些蛋白质或短肽可能具备非常独特的其至尚不为人知的翻译后加]二 修饰方式，一般的研究力‘法不能破解等． 3海洋生物技术研究的形势和主要内容 上述几个部分的研究起点是找到有具体价值的基冈．海洋生物包括微生物的研究在相当 长时间内有一定程度的“圈地运动”的性质，即各国都通过大规模的功能筛选平台尽快找到有 重大研究和开发价值的海洋生物基I矧，而不会一开始就把大量的研究资源放到从基因组到蛋