驴CSN3基因序列分析.pdfVIP

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第 30巷 第 7期(下) 赤 峰 学 院 学 报 (自然 科 学版 ) Vol_30No.7 2014年 7月 JournalofChifengUniversity(NaturalScienceEdition) Ju1.2014 陈建兴,男,1980年 出生于山西省运城市芮城县,1999年考入西北民 族大学就读动物科学专业。2006年考入青岛农业大学动物科技学院攻 读动物遗传育种与繁殖专业硕士 ,2009年获农学硕士学位。同年考入 内 蒙古农业大学动物科学学院攻读动物遗传育种与繁殖专业博士学位 , 师从双博士芒来教授 。2012年获农学博士学位。主要研究方向为动物分 子遗传学 驴 CSN3基因序列分析 陈建兴 ,陈海伟 ,毕晓丹 ,王银朝 ,雷 战 (1.赤峰学院 生命科学学院,内蒙古 赤峰 024000;2.山东东阿阿胶股份有限公司,山东 聊城 252201) 摘 要:家驴具有很大的市场开发潜力和价值.本研究通过生物信息学技术分析了家驴 CSN3基因的 序列特征 。为家驴向肉用或乳用方向选育初步提供一定的分子依据.经分析研究发现家驴 CSN3基 因共包 含五个外显子和四个 内含子.初始转录物的前 81nt为5UTR 区,后 205nt为 3UTR 区,中间的549nt为 CDS区.整个 CDS区翻译出 182个氨基酸构成的多肽.家驴的K酪蛋 白中的氨基酸以脯氨酸所 占的比例最 高(14.286%),其次为缬氨酸 (10.989%),最低的为半胱氨酸、色氨酸和甘氨酸(所 占比例都为O.5495%).各物 种 K酪蛋 白氨基酸序列间每个位点氨基酸替代数的平均值的大小能够较好反映物种 间亲缘关系的远近.K 酪蛋白氨基酸序列能够很好地反映物种之 间的亲缘关系,适合用于系统发育分析. 关键词 :驴;CSN3基 因;K酪蛋 白;序列分析 中图分类号:Q523 文献标识码 :A 文章编号:1673—260X(2014)07-0011-03 家驴 (Equus minus)是人类大约6,000年前 码成熟蛋白中的 160~169个氨基酸.第四外显子 从非洲野驴(Equus africanus)的一个或者两个亚 编码的多肽链长度 占整个成熟蛋白的85%左右.赵 种驯化而来的_1j21.随后 ,在许多文化体系中,家驴一 春江等发现 CSN3基因与中国荷斯坦牛乳蛋 白率 直作为主要的驮运家畜为人类文明的发展做出了 含量有显著相关同.蓝贤勇等的研究发现,CSN3基 巨大贡献.时至今 日,家驴和骡子在许多贫穷并且 因对奶山羊产羔数有显著影响91『.Hobor等(2006)㈣ 气候干旱的地区仍是运输重物、人员和财物的主要 鉴定了三个家马品种 CSN3第一和第四外显子上 驮畜3J【.但随着农业机械化和交通运输业的快速发 的各两个 SNP位点,随后,又对马属动物该基因的 展,在发达国家以及一些国家的发达地区,家驴这 启动子区和第四外显子区序列进行了比较分析[1l】. 样的驮运动物已被淘汰,这就导致不仅个别品种消 Selvaggi等_12J研究了Murgese马 CSN3第一外显子 失,而且家驴该物种整体也出现种质退化和种群数 两个位点的遗传多态性. 量下降的趋势 .我国家驴的养殖数量一直居世界 对于家驴 CSN3基因的研究,只是在 Hobor 之首 ,家驴的种质资源退化状况与世界范围内的 (2008)的研究[111中附带与家马和斑马的部分相应 整体局势相似圈. 序列做了比较分析,并未见到专门的研究报道.为 在哺乳动物 中,CSN3基因编码的 K酪蛋 白是

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