蛋白质二硫键异构酶结构域的克隆与活性研讨.pdfVIP

蛋白质同源结构预测方法认为相似序列的环区将会具有相似的结构，但我们的各家族内部的结构与序 列的关联计算表明未必完全如此。在101个家族中，有22个家族观察到比较明显的关联，相关系数大于 0.75.最好的相关系数为0.98。在这些家族中，依靠序列比较而预测的环区结构比较可靠。而在另外的众 多家族中，这种预测方法则不可信。这也说明了同源结构预测中环区预测确准度低的原因。因此需要对各 个家族的具体环境进行分析。此数据库的目的正是为结构预测和分子设计中环区的建设提供依据。用户可 以通过国际互联网络得到此数据库。 参 考 文 献 KwasigmchJ,ChomdierJ,MomonJ.Aglobaltaxonomyofloopsinglobularproteins.JMotBiol,1996,59:855一872 DonateLE,RufoSD,CanardLHJBlm,deH,TL.Conformationalanalysisandclusteringofshortandmediumsireloopsconnectingregularsecondary sturctures.Adatabaseformodellingandprediction.ProteinSci,1996,5:2601)一2616 buttonSD,DonateLE,CmanlLH1B1mdeU,TL.Predictingtheconfonnationalclassofshortandmediumsizeloopsconnectingregularsecondarystmc tures:applicatintocongamtioemodelling.JMotBiol,1997,267:352一367 OliveB,M e,PA,Quanletal.Anautomaticclaasiirationofthesturctureofproteinloops.JMotBird,1997,266:814一830 vanVlijmenHWTKmplusM.PDB-basedproteinloopprediction:pmammeesforselectionandmethodsforoptimisaiton.JMotBiol,1997,267:975- 1001 .,- s.e.e9C,KoeWe.., .U.ds..,浅tz.只论....r.DataB-1,二awmpater-base:ach,:a.a.cr- rctno.}-as,n.c-as.,.o,.e.,1977,112: 535-542 KabschWSanderC.Dictionaryofprotein，，响 swcture:patternrecognitionofygdrogen-bondedandgeometricalfeaturesetal.Biopolymers,1983, 22:2577一2637 Hof LunderC.Deli/FSSP司。,;a- ofthroe-a} nsiorml-- +-folds.N,卜i-AcidsP- - h.1997.25e231-234 蛋白质二硫键异构酶结构域的克隆与活性研究 刘慧萍 ‘柴玉波 ‘陈苏民2王志珍2 (1第四军医大学生化教研室 2中国科学院生物物理研究所) 摘 要 本文用基因重组的方法得到了hPDIC端两个结构域的arc蛋白片段。与bPDI全长相比，仅具有一个活性 结构域和一个多肤结合区域的ac，保留了约1/3的天然酶活力。a}c在硫氛酸酶的热变性中表现为分子伴侣和反 分子伴侣的双相功能，在溶菌酶和GAPDH的变性复性过程主要体现为反分子伴侣的作用。 关键词 蛋 白质二硫键 基 因重组 分子伴侣 反分子伴倡 析唇酶 蛋白质二硫键异构酶(proteindisulfideisomerase,PDI)是内质网新生肤链折叠中一个重要的折叠酶 (foldase)，催化二硫键的形成和异构化，同时可起到类似分子伴侣(chaperone)的作用，某些条件下对特定底物 还表现出“抗分子伴侣(anti-chaperone)”活力[[I[.PDI还是一个多功能蛋白，构成体内多种复合物的亚基，如 脯氨酞-4-经化酶的日亚基[[2].PDI不仅对蛋白质折叠的理论研究有重要意义，而且有着十分广阔的应用前 景，如PDI可以帮助某些基因工