应用ISSR-PCR对10个菊花品种进行遗传多样性分析.docVIP

应用ISSR-PCR对10个菊花品种进行遗传多样性分析 　　摘要：中国的菊花品种数量众多，形态变异丰富，适应性强，分布广泛，遗传背景非常复杂，这为菊花品种的资源调查、分类鉴定、遗传多样性分析等带来了困难。试验采用分子标记技术，对福白菊、杭白菊等１０个菊花品种进行了分类鉴定及亲缘关系研究，结果显示，在简单序列重复区间扩增－聚合酶链式反应 分子标记反应体系及引物的筛选方面，选择了条带数量多和清晰度高的菊花反应体系，应用野生福白菊对３９条ＩＳＳＲ引物进行了筛选，淘汰了扩增效果差、带型不易辨认的引物，最终确定１２条引物用于菊花品种的鉴定。ＩＳＳＲ-PCR聚类分析结果表明，１２条ＩＳＳＲ引物扩增出了１８５条清晰的、重复性好的ＩＳＳＲ条带，其中多态性条带有１７６条，多态性比率高达９５．１％。应用ＮＴＳＹＳ ２．１０ｅ软件进行ＵＰＧＭＡ法聚类分析，在相似系数０．５５处可将１０个菊花品种大致分为3类，结果福白菊与其他杭菊品种在遗传上有较大的差异。 　　关键词：菊花；简单序列重复区间扩增－聚合酶链式反应；分子标记；遗传多样性 　　中图分类号：Ｓ６８２．１＋１；Ｑ５０３ 文献标识码：Ａ 文章编号：0439－８11420－4292-06 　　 　　Genetic Diversity Analysis of Ten Chrysanthemum morifolium Cultivars Using 　　ISSR-PCR 　　 　　ＣＨＥＮＧ Ｈｕａ１，２，ＬＩ Ｌｉｎ－ｌｉｎｇ１，２，ＺＨＡＮＧ Ｘｉｎ－ｌｉｎｇ３，ＦＡＮＧ Ｊｉａ２，ＺＨＥＮＧ Ｙｏｎｇ－ｓｈｅｎｇ３，ＪＩＡＮＧ Ｄｅ－ｚｈｉ１，２， 　　ＣＨＥＮＧ Ｓｈｕｉ-ｙｕａｎ１，２ 　　 　　 　　Ａｂｓｔｒａｃｔ： Ｔｈｅ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎ， ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ， ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｃｈｒｙｓａｎｔｈｅｍｕｍ ｍｏｒｉｆｏｌｉｕｍ Ｒａｍａｔ． ｗｅｒｅ ｄｉｆｆｉｃｕｌｔｙ due ta ｉｔｓ ｎｕｍｅｒｏｕｓ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ， ａｂｕｎｄａｎｔ ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌ ｖａｒｉａｔｉｏｎ， ｐｏｗｅｒｆｕｌ ｓｕｉｔａｂｉｌｉｔｙ， ｗｉｄｅ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｘｔｒｅｍｅｌｙ ｃｏｍｐｌｉｃａｔｅｄ ｇｅｎｅｔｉｃ ｂａｃｋｇｒｏｕｎｄ． Tｈｅ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｏｆ １０ Ｃ． ｍｏｒｉｆｏｌｉｕｍ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ ｗｅｒｅ ｓｔｕｄｉｅｄ ｕｓｉｎｇ ｃｌｕｓｔｅｒ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ． Ｔｈｅ ｍａｉｎ ｒｅｓｕｌｔｓ ｗｅｒｅ ａｓ ｆｏｌｌｏｗｓ． Ｔｈｅ ｃｈｒｙｓａｎｔｈｅｍｕｍ ｒｅａｃｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ ｗｉｔｈ ｍｏｒｅ ｂａｎｄｓ ａｎｄ ｈｉｇｈ－ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ ｗａｓ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ｉｎ ｒｅａｃｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ ｏｆ ＩＳＳＲ－ＰＣＲ ａｎｄ ｐｒｉｍｅｒ ｓｅｌｅｃｔｉｎｇ． １２ ｐｒｉｍｅｒｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｆｏｒ ｔｈｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ｃ. ｍｏｒｉｆｏｌｉｕｍ ＩＳＳＲ ｃｌｕｓｔｅｒ ａｎａｌｙｓｉｓ ｓｈｏｗｅｄ that １８５ ｃｌｅａｒ ａｎｄ ｒｅｐｒｏｄｕｃｉｂｌｅ ＩＳＳＲ-PCR ｂａｎｄｓ ｗｅｒｅ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｆｒｏｍ １２ ＩＳＳＲ ｐｒｉｍｅｒｓ， １７６ ｂａｎｄｓ ｏｆ ｔｈｅｍ ｗｅｒｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ｗｉｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｒａｔｅｓ ｕｐ ｔｏ ９５．１％． １０ Ｃ． ｍｏｒｉｆｏｌｉｕｍ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ ｃｏｕｌｄ ｂｅ ｄｉｖｉｄｅｄ ｉｎｔｏ ｔｈｒｅｅ ｃａｔｅｇｏｒｉｅｓ ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ ＵＰＧＭＡ ｃｌｕｓｔｅｒ ａｎａｌｙｓｉｓ ｉｎ ｔｈｅ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ ０．５５， ｂｙ ＮＴＳＹＳ ２．１０ｅ ｓｏｆｔｗａｒｅ． Ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ ｌａｒｇｅ ｈｅｒｅｄｉｔｙ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ ｂｅｔｗｅｅｎ Ｃ． ｍｏｒｉｆｏｌｉｕｍ ｃｖ． Ｆｕｂａｉｊｕ ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ ｏｆ Ｃ. ｍｏｒｉｆｏｌｉｕｍ． 　　Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ： Ｃｈｒｙｓａｎｔｈｅｍｕｍ ｍｏｒｉｆｏｌｉｕｍ Ｒａｍａｔ．； Ｉｎｔｅｒ－ｓｉｍｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｅａｔ－Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｃｈａｉｎ ｒｅａｃｔｉｏｎ； ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｃｅｒ； ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ