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RecA引起的链交换和Holliday结构的生成
RecA引起的链交换和Holliday结构的生成 第二节 位点专一性重组 ? 整合体及其作用 整合体(intasome)--- Int和IHF结合到attP时的复合物 ? 整合体捕获attB 说明----- a、attB和attP的最初识别靠Int 识别两序列的能力 b、两序列的同源性在链交换时为 重要因素 第三节 细菌中的转座成分 一、转座成分概述 1、转座子(元)或转座元件(transposon or transposable element): 基因组上不必借助于同源序列就可以移动的DNA片段,它们可以直 接从基因组的一个位点移到另一个位点(供体和受体) 转座(transposition):转座元的转移过程(不十分确切) 2、发现和发展 ? 1914 A. Emerson 1936 Marcus . M. Rhoabes 玉米果皮、糊粉层花斑突变 玉米籽粒糊粉层色素不稳定遗传机理 跳跃基因(jumping gene) ? 1947 冷泉港实验室(美) Barbara McClintock a) 不依赖供体序列与靶位点间序列的同源性 b) 转座不是简单的转移,涉及转座子的复制 Hotspots (热点) Regional preference ( 在3kb区域内的随机插入) d) 某些转座因子(Tn3)对同类转座因子的插入具有排他性 (免疫性) e) 靶序列在转座因子两侧会形成正向重复 f) 转座因子的切除与转座将产生复杂的遗传学效应 3、转座重组的特点 c) 转座插入的靶位点并非完全随机(插入专一型) 二、Prok.转座子种类 ? 两种类型: 简单转座子(simple transposon) (插入序列 insertion sequence IS ) 复合转座子(composite transposon) ? 共同特征: a)两端有20~40bp的IR b)具有编码转座酶(transposase)的基因 1、插入序列 ? 最简单,是细菌染色体、质粒和某些噬菌体的正常组分 ? 命名: IS+编号(鉴定类型) 长度 700~2000bp ? 特点: a)两端IR为转座酶的识别位点(突变) b)插入靶位点后会出现靶位点的正向重复(3~9bp) ? IS 可以正反方向插入到DNA(宿主、质粒或某些噬菌体), 常对插入位点后面的基因表达功能产生极性效应 a) Tn / TnA family l 具有IR、转座酶基因、 调节基因(解离酶)、抗抗生素基因 l??????? Tn1 (AmpR) Tn2 (AmpR) Tn3 (AmpR) Tn4 (AmpR StrR) Tn5 (KanR) Tn6 (kanR) Tn7 (StrR TmpR) Tn9 (CamR) Tn10 (TetR) 2.5 kb 20 kb Tn3 IR TnpA Res TnpR AmpR IR 38bp 38bp 转座酶 regulator β- 内酰胺酶 2、复合转座子 ? 两种类型 b)两端重复序列为IS的复合转座子 e.g. IS插入到功能基因两端,可能形成复合转座因子 IS IS IS IS L IS R 臂 中心区 臂 transposition ? 当两个IS组件相同时,其中任一个都可行使转座功能 ? 不同时,主要依靠一个 ? 两侧的IS既可以是IR,又可以是DR状态 (IR多) 3
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