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[教育学]细胞生物学-核糖体
CELL BIOLOGY 第一章 绪论 第二章 细胞基本知识概要 第三章 细胞生物学研究方法 第四章 细胞质膜与细胞表面 第五章 物质跨膜运输与信号传递 第六章 细胞质基质与内膜系统 第七章 细胞的能量转换 第八章 细胞核与染色体 第九章 核糖体 第 十 章 细胞骨架 第十一章 细胞增殖及其调控 第十二章 细胞分化与基因表达调控 第十三章 细胞衰老与凋亡 第九章 核糖体(ribosome) 第一节 核糖体的类型与结构 根据沉降系数的不同分为70S和80S两种类型。 70S核糖体存在于细菌,线粒体和叶绿体中,80S 核糖体存在于真核生物的细胞质中。 40% 的蛋白质、60% 的RNA。 由大小两个亚基构成,只在以 mRNA 为模板合成蛋白质时才结合在一起,肽链合成终止后,大小亚单位又解离。 原核和真核细胞的 rRNA 都具有甲基化现象,甲基化与 RNA 转录后加工过程的酶识别有关,另外原核5S rRNA和真核5.8S rRNA结构高度保守,常用于研究生物进化。 二、核糖体的结构 1、离子交换树脂可分离纯化各种r蛋白; 2、纯化的r蛋白与纯化的 rRNA 进行核糖体的重组装,显示核糖体中r蛋白与 rRNA的结构关系: ?蛋白质结合到 rRNA 上具有先后层次性。 ?核糖体的重组装是自我装配过程 3、双功能的交联剂和双向电泳分离可用于研究 r 蛋白在结构上的相互关系 ?同一生物中不同种类的 r 蛋白的一级结构均不相同,在免疫学上几乎没有同源性。 ?不同生物同一种类 r 蛋白之间具有很高的同源性, 并在进化上非常保守。 4、电镜负染色与免疫标记技术结合,研究r蛋白在核糖体的亚单位上的定位。 5、对rRNA,特别是对16S rRNA结构的研究 ?16SrRNA的一级结构是非常保守的 ?16SrRNA的二级结构具有更高的保守性: 臂环结构(stem-loop structure) ?rRNA臂环结构的三级结构模型 6、70S核糖体的小亚单位中rRNA与全部的r蛋白关系的空间模型 ※ 双向电泳(Two-dimensional(2D) gel electrophoresis)是一项基于蛋白的两种不同特性:电荷和质量来分离蛋白的技术。首先基于蛋白固有电荷,通过等电聚焦(isoelectric focusing IEF)进行第一向蛋白分离,然后根据蛋白的质量,在第二向中通过SDS电泳进行蛋白分离。 (二)蛋白质合成过程中很多重要步 骤与50S核糖体大亚单位相关 ?涉及的多数因子为G蛋白(具有GTPase活性),核糖体上与之相关位点称为GTPase相关位点。 ?最近人们成功地制备L11-rRNA复合物的晶体,获得了其空间结构高分辨率的三维图象。 ?这一结果证实了前人用各种实验技术所获得的种种结论 ?提出直观、可靠且比人们的预料更为精巧复杂和可能的作用机制,从 而为揭开核糖体这一具有30多亿年历史的古老的高度复杂的分子机器 的运转奥秘迈出了极重要的一步。 ?与mRNA的结合位点 ?与新掺入的氨酰-tRNA的结合位点——氨酰基位点,又称A位点。 ?与延伸中的肽酰-tRNA的结合位点——肽酰基位点,又称P位点。 ?肽酰转移后与即将释放的tRNA的结合位点——E位点(exit site)。 ?与肽酰tRNA从A位点转移到P位点有关的转移酶(即延伸因子EF-G)的结合位点 ?肽酰转移酶的催化位点 ?与蛋白质合成有关的其它起始因子、延伸因子和终止因子的结合位点 (二)在蛋白质合成中肽酰转移酶的活性研究 ?很难确定哪一种蛋白具有催化功能: 在 E.coli 中核糖体蛋白突变甚至缺失并不完全抑制蛋白质合成。 ?多数抗蛋白质合成抑制剂的突变株,并非由于 r 蛋白的基因突变而往往是 rRNA 基因突变。 ?在整个进化过程中 rRNA 的结构比核糖体蛋白的结构具有更高的保守性。 rRNA 可能具有更重要的作用。 2、在核糖体中 rRNA 是起主要作用的结构成分 ?具有肽酰转移酶的活性; ?为 tRNA 提供结合位点(A位点、P位点和E位点); ?为多种蛋白质合成因子提供结合位点; ?在蛋白质合成起始时参与同 mRNA 选择性地结合以及在肽链的延伸中与mRNA 结合; ?核糖体大小亚单位的结合、校正阅读(proofreading)、无意义链或框架漂移的校正、以及抗菌素的作用等都与 rRNA 有关。 3、r 蛋白质的主要功能 ?对 rRNA 折叠成有功能的三维结构是十分重要的; ?在蛋白质合成中,某些 r 蛋白可能对
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