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- 2018-03-02 发布于浙江
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[医学]协和2011基因分子生物学复习
基因分子生物学2011期末复习题总结
(只背这些就够了,然后认真看出填空题的老师的课件)
一. control of prokaryotic gene expression
Ⅰ名词解释
1. Operon 操纵子,是基因表达调控的基本单位,包含结构基因、操纵基因等一些相邻基因组成的DNA片段,其中操纵基因可被调节蛋白识别并调控,结构基因的表达又受到操纵基因的调控。
2. Inducible operon 可诱导操纵子,当环境出现某一小分子时,与代谢相关的基因表达,即诱导物所诱导的操纵子为可诱导操纵子,如lac操纵子,在诱导物作用下可产生本身代谢所需要的酶。
3. Operator 操纵基因,是操纵子结构基因前的DNA区段,可以结合阻遏物或活化物。常位于基因启动子的后面或与启动子重叠,可控制临近结构基因的表达。
4. Co-repressor辅阻遏物,阻遏蛋白与某一个小分子结合后活性被激活,阻止产生合成这种小分子相关的酶,那么这种小分子称为~~,例如色氨酸。
5. Repressible operon 可阻遏操纵子,共阻遏物所抑制的操纵子为可阻遏操纵子,即共阻遏物的存在可以抑制结构基因所编码酶的表达,如trp操纵子等氨基酸合成相关的操纵子。
6. Attenuator 衰减子, 是E. coli Trp操纵子一段特殊的调控序列。位于上游启动子与第一个结构基因之间,是Trp操纵子含有的一个特殊调节序列,色氨酸操纵子的前导序列有4个关键区,当大肠杆菌细胞中色氨酸水平较高,核糖体迅速的翻译前导序列中的序列1,生成14肽,并在转录序列3之前占据序列2转录产物,以致前导序列转录产物序列3和序列4互补,形成类似终止子的衰减子结构。.
7. Alarmones 信号素,原核生物应急反应中所产生的信号分子,ppGpp or pppGpp(鸟苷4/5磷酸),它们通过与靶蛋白的结合来改变其活性即刻产生调控作用,从而对代谢做出调节。
8. Prophage 原噬菌体,某些温和噬菌体侵染细菌后,其DNA整合到宿主染色体上,处于整合状态的噬菌体DNA为原噬菌体。它是繁殖和传递噬菌体本身遗传信息的一种重要方式。
9. Riboswitch 核糖开关,是原核生物中一类调节RNA元件,它可以直接感受小分子的代谢来控制转录和翻译,是不依赖调控蛋白的一种调节方式。
10. sRNAs 细菌内小RNA,sRNAs是细菌内长80~100 nt的RNA调控序列。它们一般不由大的RNA前体形成,而是被自身基因所编码产生。大多数的sRNA通过与靶mRNA配对来抑制转录,有些情况也促进转录。
11. Antisense RNAs反义RNA,由+DNA链转录产生。一个RNA可以与某一个基因转录出的mRNA互补,那么这个RNA则称为此mRNA的反义RNA,抑制mRNA的翻译,主要在翻译水平上调节基因表达的一种RNA(少数可调节其转录)。
Ⅱ简答
1. 简述lac operon的调控机制。
Lac操纵子由操纵基因O、结构基因Z、Y、A及调节基因组成。lac操纵子在启动子的-35区缺乏UP元件,为弱启动子。CAP和Repressor分别通过影响RNAP与启动子的结合来对lac基因进行调控。是通过CAP蛋白的正调节和Repressor的负调节这两种调节来实现的
当葡萄糖和乳糖都存在时,由于葡萄糖的存在,细胞中的cAMP 的水平则会降低,而cAMP对CAP的活性是必须的,所以此时CAP无活性,不能和CAP site 结合;而由于乳糖的存在,它可以与Repressor结合使其构象改变,从而不能结合在operator上,此时RNAP结合在启动子上,由于lac gene 的启动子是弱启动子,在没有CAP蛋白结合时,RNAP与之的结合比较弱,处于基础水平转录;
当只有葡萄糖存在时,此时CAP 蛋白依然没有活性,不能和CAP site 结合;由于没有乳糖存在,此时阻遏蛋白结合到操纵基因上,启动子和操纵基因有重叠区,Repressor的结合阻止了RNAP与启动子的结合,阻止了转录的发生;
当只有乳糖存在时,cAMP浓度升高,此时CAP与cAMP结合,表现出较高的活性,结合于CAP site;此时乳糖与repressor结合,使其构象改变,不能结合在operator上,RNAP则可与启动子结合;而CAP蛋白具有募集作用,可以帮助RNAP结合到启动子上,从而使得转录水平大大升高;
当两种糖都不存在时,CAP 可以结合到CAP site上;同时repressor也结合到operator上,阻止RNAP 的结合,阻止基因的转录。
2. 如何利用实验证明CAP蛋白的作用机制。
CAP蛋白的作用机制是募集RNAP到启动子上,可以用激活蛋白旁路实验来证明。
1)用蛋白与蛋白的相互作用取代CAP跟R
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