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蛋白质组学与疾病 什么是蛋白质组（proteome）？  蛋白质组（proteome）是澳大利亚学者 Williams和Wilkins于1994年首先提出，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的杂合，意指proteins expressed by a genome，即“一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质”。 什么是蛋白质组学(proteomics)？ 指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学，其目的是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。 蛋白质组学研究的历史与背景 随着人类基因组计划的实施和推进，生命科学研究已进入后基因组时代。在这个时代，生命科学的主要研究对象是功能基因组学，包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。 1996年，澳大利亚建立世界第一个蛋白质组研究中心APAF。 丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国，各大药厂和公司在巨大财力的支持下，也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。 瑞士 蛋白质组数据库“SWISSPROT”。 2001年4月，在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织（Human Proteome Organization, HUPO）,随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织，试图通过合作的方式，融合各方面的力量，完成人类蛋白质组计划（Human Proteome Project）。 我国也于1998年启动了蛋白质组学研究，并举办了多次全国性的蛋白质组学研讨会。 疾病蛋白质组学（disease proteomics） 以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象，主要研究蛋白质的种类、分布、代谢特征、蛋白质表达调控、蛋白质的磷酸化、泛素化等翻译后修饰及其蛋白质的功能作用与疾病之间的关系。 目前，疾病蛋白质组学的研究主要涉及了肿瘤、肝病、心血管疾病及神经退行性疾病等，其中，肿瘤最受关注，研究几乎涉及了所有的常见肿瘤，包括乳腺癌、肝癌、肠癌、肺癌、食管癌、以及白血病等。 主要内容： 建立各种肿瘤的蛋白质组数据库 寻找肿瘤相关蛋白质 分析肿瘤相关蛋白质的结构和功能 意义： 揭示肿瘤发生的分子机制 为诊断、防治和新药开发提供依据和靶标 肿瘤蛋白质组学研究 蛋白质组学,一种新型检测、治疗癌症的工具 生物样品 纯化 双向凝胶电泳 多维液相色谱 蛋白质的分离 准备鉴定定量 回收 标记 质谱 鉴定 激光解吸电离/飞行时间质谱法 ,电喷雾质谱法 表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱 数据分析 结果：蛋白表达的变化 生物信息技术 肿瘤蛋白质组学研究进展：教材p124-127 1.比较蛋白质组学研究揭示肿瘤发病机制，寻找肿瘤诊断和治疗的靶标； 2.血清蛋白质组学研究寻找肿瘤相关抗原； 3. 肿瘤药物蛋白质组学研究： （1）发现药物靶蛋白（药物蛋白质组学）； （2）肿瘤药物作用机制研究和新药筛选。 例一 丹麦的一个研究小组利用蛋白质组研究技术结合组织冰冻切片技术分析了150例膀胱癌患者的组织,发现在所有的鳞状细胞癌患者的尿液中均能发现一种与膀胱癌相关的蛋白质———银屑素(psoriasin), 推测其极可能作为这种肿瘤的早期标志物, 可用于膀胱鳞状细胞癌的早期诊断、鉴别诊断和病情监控。 例二 意大利的Sarto C 等通过比较分析正常肾组织和肾细胞癌的蛋白质双向电泳图谱，发现有4种蛋白质在肾细胞癌中缺失，其中2个与线粒体氧化还原功能有关，说明线粒体氧化还原功能障碍在肾细胞癌的发生、发展中起重要作用。 例如：乳腺癌患者血清蛋白质组分析，发现Rs/DJ-1为乳腺癌抗原，仅在乳腺癌组织中表达，而未见于正常组织。 心血管疾病蛋白质组学研究 主要涉及心肌病、缺血性心脏病、心肌肥厚、心力衰竭和动脉粥样硬化等疾病。 扩张性心肌病是迄今为止利用蛋白质组学技术研究最为深入的疾病，发现与正常心肌组织相比，有100多种蛋白质表达下调，已发现的差异蛋白质分为细胞骨架及肌纤维蛋白、能量代谢相关蛋白以及应激相关蛋白三类。 心血管疾病蛋白质组学研究进展：教材p128-129 练习题 何谓单基因遗传病？简述其基本类型。 何谓多基因遗传病，有何特点？ 试述疾病蛋白质组学的概念、目前的研究重点及其核心技术。（p122） 试述肿瘤蛋白质组学研究进展。 试述心血管疾病蛋白质组学研究进展。