生物信息学:第八讲:KEGGpathway和Primer3引物设计.pptVIP

生物信息学:第八讲:KEGGpathway和Primer3引物设计.ppt

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生物信息学:第八讲:KEGGpathway和Primer3引物设计

第八讲:KEGG pathway 和Primer3 引物设计 KEGG 是目前查询代谢途径网络和重建代谢途径网络做的最好的网络资源 主页 例:查询ABC transporter代谢途径网络 点击主页重点的pathway 显示各种pathway 查找ABC transporter pathway 点击查看ABC transporter pathway 点击KO list 查看 点击5th level 查看 Primer3 引物设计 Primer3简单方便 可以满足基本的引物设计需要 主页 例:对给定的一段DNA序列采用默认或特定要求参数设计引物 默认设计引物:输入DNA序列点击提交 查看结果 按需要修改参数设计引物 查看结果 作业: 1. 查看Two-component system代谢途径网络 2. 对给定的seq1采用默认的参数设计引物 3.对给定的seq2要求引物设计在1000-1100两边,且不能设计在100-200,1500-1840中,引物长度为21-25之间,引物退火温度在53-55直接,GC含量在40-64之间 * * *

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