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蛋白质的合成、修饰及分泌 Synthesis, Modification and Secretion of Protein 上节课内容 一、蛋白质概念 二、组成 化学组成 组成氨基酸 三、结构 共价结构 空间结构 四、功能 五、蛋白质结构与功能的关系 六、蛋白质的理化性质 七、研究蛋白质功能的方法 本节课内容 蛋白质的合成 蛋白质翻译后修饰 蛋白质的折叠 蛋白质的靶向转运 DNA ? RNA ? Protein DNA ? RNA ? Protein 中心法则central dogma (1)密码子的方向性(directivity) 密码子的阅读方向及它们在mRNA由起始信号到终止信号的排列方向均为5?-3?,与mRNA链合成时的延伸方向相同。 (2)密码子的简并性(degeneracy) 64-3=61个代表20种氨基酸,仅甲硫氨酸、色氨酸只有一个密码子。一个氨基酸可以有几个不同的密码子,编码同一个氨基酸的一组密码子称为同义密码子。这种现象称为密码子的简并性,意义? (3)密码子的连续性(commaless)从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。既不存在间隔(无标点),也无重叠。在mRNA分子上插入或删去一个碱基,会使该点以后的读码发生错误,称为移码,由这种情况引起的突变称为移码突变。 (4)密码子的通用性(universal) 各种低等和高等生物,包括病毒、细菌及真核生物,基本上共用同一套遗传密码。有例外:真核生物线粒体DNA的编码方式与通常遗传密码有所不同。 (6)密码子的偏爱性 同一个氨基酸有多个密码子,但对原核、酵母及哺乳动物细胞来说,其中有一两个是被优先选用的。 基因工程中,人工合成靶基因时尤其要注意在不同表达系统中选择不同的密码子。 (7)起始密码子和终止密码子 在64种密码子中,AUG为甲硫氨酸的密码子,又是肽链合成的起始密码子,UAA、UAG、UGA为终止密码子,不编码任何氨基酸,而成为肽链合成的终止部位(无义密码子)。 蛋白质合成概述 1. 原料:氨基酸 2. 模板:mRNA 3. 运载工具:tRNA 4. 装配场所:核糖体 5. 能量:GTP,ATP 6. 酶:氨基酰tRNA合成酶;转肽酶 7. 蛋白因子:起始、延长、终止各阶段有蛋白因子参与,如果是真核生物,则在这些因子前加“e” (eukaryotic),如:eIF、eRF等。 mRNA(messenger RNA)的概念首先是由Jacob和Monod 1961年提出来的。当时已经知道编码蛋白质的遗传信息载体DNA是在细胞核中,而蛋白质的合成是在细胞质中,于是推测:应该有一种中间信使在细胞核中合成后携带遗传信息进入细胞质中,指导蛋白质的合成。后来发现了除核糖体RNA和转运RNA之外的第三种RNA,它起着这种遗传信息传送的功能, 称为信使RNA(mRNA)。 mRNA的半衰期很短,极不稳定,一旦完成其使命后很快就被水解掉。 原核生物和真核生物mRNA的结构差异较大,尤其是在5’端。 (1)5’端SD序列 起始密码子AUG上游9-13个核苷酸处,有一段可与核糖体16S rRNA配对结合的、富含嘌呤的3-9个核苷酸的共同序列,一般为AGGA,此序列称SD序列。它与核糖体小亚基内16S rRNA的3’端一段富含嘧啶的序列(称反SD序列)互补,形成氢键。使得结合于30S亚基上的起始tRNA能正确地定位于mRNA的起始密码子AUG。 (2)原核mRNA分子,许多是多顺反子。原核生物一条连续的mRNA链往往为功能相关的几种蛋白质(例如一个酶系统)编码 。如E. coli中一个7000bp的mRNA编码5种与Trp合成有关的酶。 (1)真核生物mRNA 5’端有m7GpppN帽子结构,无SD序列。 帽子结构具有增强翻译效率的作用。若起始AUG与帽子结构间的距离太近(小于12个核苷酸),就不能有效利用这个AUG,而从下游适当的AUG起始翻译;当距离在17-80个核苷酸之间时,离体翻译效率与距离成正比。 mRNA是遗传信息的携带者 2.tRNA转运活化的氨基酸至mRNA模板上 tRNA(transfer RNA)在蛋白质合成中,起着运载氨基酸的作用,按照mRNA链上的密码子所决定的氨基酸顺序将氨基酸转运到核糖体的特定部位。 同功受体tRNA: 一种氨基酸可以有一种以上tRNA作为运载工具。把携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNA称为同功受体tRNA。 反密码子(anticodon):tRNA分子上三个特定的碱基组成一个反密码子,位于反密码子环上。 tRNA is a connection between anticodon and a
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