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第二章 DNA重组技术与基因操作 §2·2 限制性内切酶(Restriction Endonuclease, RE) 作业:现有一长度为12kb的DNA片段,用EcoR I完全酶解,产生3kb、4kb、5kb三种片段;用Hind III 完全酶解,产生2kb、4kb、6kb三种片段;最后用两种酶完全酶解,产生1kb、2kb、3kb、4kb四种片段。请绘出葡聚糖凝胶电泳结果,并确定这段DNA片段的内切酶图谱。 §2·3 克隆载体(cloning vector) §2·3·1 质粒载体(Plasmid vector) §2·3·2 入-噬菌体载体(入-phage vector) §2·3·4 丝状噬菌体载体——M13 一、M13噬菌体结构与生活史 具有丝状的蛋白质外壳,其基因为单链正链DNA(+ssDNA) 二、改造成载体 M13 基因组有6.5kb,其中有507nt可以被外源DNA所更替。 作为载体的优点: ? 被复制,最终释放出的重组M13噬菌体的基因为+ssDNA ? 可用作模板进行序列分析; ? 还可用于制备单链探针。 §2·3·5 酵母人工染色体(YAC) 一、酵母人工染色体(Yeast Artificial Chromosome, YAC)的基本构成: ?着丝粒(centromere, CEN)— 保证姊妹染色体在有丝分裂时被正确地分配到各子细胞。 ?端粒(telomere , TEL)— 位于染色体末端,可防止染色体被核酸酶切割掉。 ?自主复制序列(automatic replication sequence , ARS)— 即真核生物染色体的复制起始点。 ? 筛选标记— 一些抗性基因或一些必需的合成酶基因 TEL 目的基因 ARS CEN 筛选标记 TEL 二、YAC的优缺点 YAC的优点:可容纳1000kb以上的外源DNA片段, ?一来可以保证基因结构的完整性; ?二来可以大大地减少核基因库中所需的克隆数 缺点:插入的外源DNA片段重组率高。 §2·4 原核细胞的转化与筛选 一、转化(Transformation) 所谓的转化,是指将质粒、噬菌体DNA或以它们为载体构建的重组体导入宿主细胞,从而使宿主细胞获得新表型的过程。 ?其中,宿主是指受体细胞,也是重组体复制和表达的场所,为了保证重组体DNA不被分解,宿主细胞一般为限制性内切酶缺陷型,又称重组缺陷型(RecA-)。 §2·5 原核生物基因组文库的构建与筛选 一、概念 基因组(genome),又称基因组DNA,是指一生物体所含的全部DNA。 基因组文库(genomic library),包含有该基因组全部DNA的克隆组,其中一个克隆是含有该基因组的一个小片段的重组子的宿主细胞。 §2·5 原核生物基因组文库的构建与筛选 二、基因组文库的构建 §2·6 获得真核生物目的基因的方法 四、入-噬菌体的基因组成 用BamH I切,可将入-phage DNA 分成3部分: L region 1/E R region 20kb 18kb 12kb 编码外壳蛋白 编码有关整合、 编码与DNA复制、 切割的酶 细胞裂解的酶 ● 五、入-phage vector 的构建 一般用外源目的基因来取代1/E部分,可见该载体所能容纳的外源目的基因的大小为:15~20kb。 ★ 注意:对入-phage vector 的大小要控制在38kb~52kb之间,才具有侵染力。 §2·3·3 柯斯质粒(cosmid) 是由Collins Hohn 于1978年构建出来的——利用入-phage DNA的cos区克隆到一般质粒,如pBR322上, 总长度为4~6kb,这样该载体可携带的外源基因可达40到50kb。 ★特点: ①具有抗药性和复制起始点(源于质粒载体); ②具有MCS; ③带有cos位点,只有两个cos位点之间的DNA序列长度为野生型入-DNA大小的75%~105%时,才能被包装成具有侵染
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