不同地区自然发酵乳中乳酸乳球菌多位点序列分型分析-analysis of multi-site sequence typing of lactococcus lactis in natural fermented milk from different regions.docxVIP
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不同地区自然发酵乳中乳酸乳球菌多位点序列分型分析-analysis of multi-site sequence typing of lactococcus lactis in natural fermented milk from different regions
目 录
HYPERLINK \l _bookmark0 1 引言 1
HYPERLINK \l _bookmark1 1.1 乳酸菌 1
HYPERLINK \l _bookmark2 1.2 乳酸乳球菌 1
HYPERLINK \l _bookmark3 1.3 多位点序列分型技术 2
HYPERLINK \l _bookmark4 1.3.1 多位点序列分型方法 2
HYPERLINK \l _bookmark5 1.3.2 多位点序列分型技术在流行病学中的应用 3
HYPERLINK \l _bookmark6 1.3.3 多位点序列分型在乳酸菌中的应用 4
HYPERLINK \l _bookmark7 1.3.4 多位点序列分型在乳酸乳球菌中的应用 6
HYPERLINK \l _bookmark8 1.4 研究基础、目的及意义 6
HYPERLINK \l _bookmark9 2 材料与方法 7
HYPERLINK \l _bookmark10 2.1 试验材料 7
HYPERLINK \l _bookmark11 2.1.1 样品来源 7
HYPERLINK \l _bookmark13 2.1.2 常用试剂 13
HYPERLINK \l _bookmark14 2.1.3 主要仪器设备 13
HYPERLINK \l _bookmark15 2.1.4 数据处理软件 13
HYPERLINK \l _bookmark19 2.2 试验方法 15
HYPERLINK \l _bookmark20 2.2.1 菌株培养 15
HYPERLINK \l _bookmark21 2.2.2 基因组 DNA 提取 15
HYPERLINK \l _bookmark22 2.2.3 基因组 DNA 的检测 16
HYPERLINK \l _bookmark23 2.2.4 持家基因 PCR 扩增 16
HYPERLINK \l _bookmark27 2.2.5 测序及序列分析 19
HYPERLINK \l _bookmark28 2.2.6 生物信息学分析 19
HYPERLINK \l _bookmark29 3 结果与分析 19
HYPERLINK \l _bookmark30 3.1 DNA 检测结果 19
HYPERLINK \l _bookmark32 3.2 持家基因扩增结果 20
HYPERLINK \l _bookmark36 3.3 12 个持家基因的测序结果 22
HYPERLINK \l _bookmark38 3.4 生物信息学分析结果 23
HYPERLINK \l _bookmark39 3.4.1 MLST 分型结果 23
HYPERLINK \l _bookmark41 3.4.2 等位基因多样性分析 29
HYPERLINK \l _bookmark43 3.4.3 等位基因序列重组分析 31
HYPERLINK \l _bookmark44 3.4.4 eBURST 分析结果 31
HYPERLINK \l _bookmark47 3.4.5 最小生成树结果分析 34
HYPERLINK \l _bookmark52 3.4.6 聚类分析结果 39
HYPERLINK \l _bookmark54 4 结论 42
HYPERLINK \l _bookmark55 致 谢 44
HYPERLINK \l _bookmark56 参 考 文 献 45
HYPERLINK \l _bookmark57 作 者 简 介 51
插图和附表清单
1.
HYPERLINK \l _bookmark31 图 1
HYPERLINK \l _bookmark31 基因组 DNA 的琼脂糖凝胶电泳图 20
2.
HYPERLINK \l _bookmark33 图 2
HYPERLINK \l _bookmark33 12 个持家基因在 Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 全基因组上的位点分布20
3. HYPERLINK \l _bookmark34 图 3 IMAU10464 的 12 个持家基因的核心片段 PCR 扩增结果 21
4. HYPERLINK \l _bookmark35 图 4 部分持家基因扩增产物 21
5. HYPERLINK \l _bookmark37 图 5 菌株 IMAU10464 recA 基因的序列及峰图 22
6. HYPERLINK \l _bookmark45
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