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二、空间结构与功能的关系 (一)变性——蛋白质功能丧失 1、变性及变性因素 在某些物理或化学因素的作用下,蛋白质特定的空间构象被破坏,从而导致其理化性质改变和生物学功能丧失的现象,称为变性(denaturation) 二硫键和非共价键的破坏,没有肽键的破坏和氨基酸的改变。 化学因素、物理因素。 生物化学与分子生物学教研室 Biochemistry molecular biology department 生物化学与分子生物学教研室 第一章蛋白质的结构与功能 (protein structure and function) 第一节 蛋白质的分子组成 蛋白质的主要生理功能 蛋白质(protein)是生活细胞内含量最丰富、功能最复杂的生物大分子,并参与了几乎所有的生命活动和生命过程。因此,研究蛋白质的结构与功能始终是生命科学最基本的命题。 生物体最主要的特征是生命活动,而蛋白质是生命活动的体现者,具有以下主要功能: 催化功能;结构功能;调节功能;防御功能;运动功能;运输功能;信息功能;储藏功能 ? ? ? ? ? ? 组成元素: 碳、氢、氧、氮、硫 其他:磷、金属元素、碘 氮:16% 蛋白质含量 = 氮量 100 蛋白质量 = 16× 蛋白质量 = 100 × 氮量 含氮量 ×100 16 = 含氮量 × 6.25 一、氨基酸(amino acid,aa) 是蛋白质的基本组成单位。组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种。 C H COOH NH2 R 分类的依据 ? ? (一)aa的分类 (1)非极性、疏水性aa (2)极性、中性aa (3)酸性aa (4)碱性aa 2个半胱氨酸通过脱氢后以二硫键相结合,形成胱氨酸。蛋白质中不少半胱氨酸 以胱氨酸的形式存在。 非蛋白质氨基酸,修饰氨基酸。 pH = pI 净电荷=0 pH pI 净电荷为正 pH pI 净电荷为负 CH R COOH NH3+ CH R COO NH2 CH R COO NH3+ + H+ + OH- + H+ + OH- 1、两性电离及等电点:在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH称为该氨基酸的等电点(isoelectric point,pI)。 (二)氨基酸的理化性质 2、紫外吸收性质:色aa、酪aa的最大吸收峰值在280nm附近,用于分析蛋白质含量。 酪氨酸275nm 色氨酸280nm 3、茚三酮反应:aa和茚三酮反应可生成紫色化合物,最大吸收峰在570nm处。 二、肽与肽键 (peptide) 氨基酸通过肽键(peptide bond)相连形成的链状化合物称为肽。 2个氨基酸叫二肽,3个叫三肽…… NH2 CH R1 C O OH NH CH R2 C O OH H NH2 CH R1 C O C N CH R2 O OH H …… …… ①残基 ③多肽链主链 ④游离端 ⑤方向 ②多与寡 第二节 蛋白质的分子结构 多肽链中氨基酸的排列顺序称为蛋白质的一级结构(primary structure)。这是蛋白质最基本的结构,是蛋白质高级结构和生物功能的基础。 一、蛋白质的一级结构 主要化学键:肽键 核糖核酸酶A的一级结构 牛胰岛素的一级结构 某一段肽链的主链骨架的盘绕和折叠。 主要:α- 螺旋、β- 折叠、β- 转角、无规卷曲 二、蛋白质的空间结构 (一)二级结构(secondary structure) 1、α-螺旋(α-helix) 2、β-折叠(β-pleated sheet) 多肽主链充分伸展,形成上下起伏的锯齿状结构,称为β-折叠。 两条以上的β-折叠多肽链(或一条多肽链的若干肽段)侧向集聚、形成片层结构,即称为β-片层结构。 类别:平行 反平行 3、β-转角(β-turn) 多肽链中肽段出现180°回折时的结构成为β-转角。 4、无规卷曲(random coil) 主链构象的规律不明显。 5、模体(motif) 几个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近、相互作用,形成一个具有特殊功能的空间结构,称模体或模序(超二级结构)。 二级结构的主要键:氢键。 1、概念:在二级结构等结构基础上,由于侧链R基团的相互作用,整条肽链进行范围广泛的折叠和盘曲,即整条肽链所有原子在三维空间的整体排布。 (二)三级结构(tertiary structure) 肌红蛋白由153个氨基酸构
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