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三个新大白菜CBL基因鉴定和特征分析 　　摘 要：利用大白菜已知CBL基因序列，在公共核酸数据库中重新搜索比对大白菜的基因组序列，鉴定出3个新的大白菜CBL基因，并对这3个基因的结构、遗传进化和顺式元件进行了分析，为进一步克隆和研究这些基因的功能提供了有益借鉴。 　　关键词：大白菜；CBL基因；基因结构；遗传进化；顺式元件 　　中图分类号：Q785 文献标识号：A 文章编号：1001-4942（2012）12-0007-04 　　Identification and Characteristics Analysis of Three Novel 　　CBL Genes from Chinese Cabbage 　　Zhang YongTao1， Liu LiFeng2， Li HuaYin2， Zhang YiHui2， Wang HuanQin3， 　　Wang FengDe2， Gao JianWei2， Li LiBin2* 　　（1.Institute of Vegetables， Linyi Academy of Agricultural Sciences， Linyi 276012， China； 　　2.Institute of Vegetables， Shandong Academy of Agricultural Sciences/Shandong Key Laboratory for Biology of 　　Greenhouse Vegetables/Shandong Branch of National Vegetable Improvement Center， Jinan 250100， China； 　　3.Leling Agricultural Bureau， Leling 253600， China） 　　Abstract Three novel CBL genes were indentified from Chinese cabbage by using the known CBL genes of Chinese cabbage as queries to blast the Chinese genome sequences in public nuclear acid databases. The structure， phylogeny and cis-elements of these genes were analyzed. This study provided valuable information for further cloning and functional analysis of these novel CBL genes. 　　Key words Chinese cabbage； CBL genes； Gene structure； Phylogeny；Cis-elements 　　近年来研究表明，植物中一类与钙结合的蛋白（类钙调磷酸酶B亚基蛋白，Calcineurin-B like protein）基因CBL家族在植物应答干旱、盐碱、低温胁迫、矿质营养吸收、ABA以及钙信号转导过程中具有重要功能[2，5，10，13，15，17]，CBL蛋白主要是作为钙感受器与一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（CIPK）互作来调控下游基因的表达，以响应各种不同的逆境和激素信号[2，4]。例如，在拟南芥中CBL4（SOS3）和CBL10蛋白可以和CIPK24（SOS2）结合，调控下游基因SOS1（钠离子/质子-反向运输的载体）的表达，促进细胞中钠离子的排出，从而提高植物对盐胁迫的抗性[2，11，16]。又如，在拟南芥中CBL1和CBL9与CIPK23结合，调控下游基因AKT1的表达，从而促进钾离子的吸收[7，17]。另???，AtCBL2和CIPK11结合可以调控拟南芥对碱（高pH）的抗性[8]；拟南芥AtCBL1、2、3、5、10基因在干旱、盐胁迫和ABA信号应答过程中具有重要功能[4，9，12，14，16]。在水稻、玉米等农作物中也有研究[3，8，9，11]，但在我国重要蔬菜作物中缺乏系统研究。在以往的研究中，本文作者通过生物信息学分析，从大白菜基因组中鉴定出13个CBL基因，并对它们的遗传进化进行了分析[1]。在此基础上，作者利用大白菜已知CBL基因序列，在公共核酸数据库中重新搜索比对大白菜的基因组序列，鉴定出3个新的大白菜CBL基因，并对这3个基因的结构、遗传进化和顺式元件进行了分析，为进一步克隆和研究这些基因的功能奠定了基础。 　　1 研究方法 　　利用大白菜已知CBL基因序列在GenBank中重新搜索比对大白菜的基因组序列 （http：//