沙棘弗兰克氏和非弗兰克氏放线菌的分离 培养及分子鉴定-isolation, culture and molecular identification of franchi and non - franchi actinomycetes from hippophae rhamnoides l..docx
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                沙棘弗兰克氏和非弗兰克氏放线菌的分离 培养及分子鉴定-isolation, culture and molecular identification of franchi and non - franchi actinomycetes from hippophae rhamnoides l.
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摘	要
沙棘(Hippophae rhamnoides L.)属胡颓子科沙棘属植物,是我国北方半干旱 地区的先锋树种,因其能与弗兰克氏菌(Frankia)共生在根部形成固氮根瘤, 能将大气中分子态的氮还原成氨供植物吸收利用,能在瘠薄土壤和较恶劣的环境 中生长,是改良土壤、治理水土流失、改善生态环境的优良生态经济型树种。并 且,沙棘的果、叶和种子中含有大量的营养成分和对人体有重要意义的生物活性 物质。
为了更好的开发利用沙棘共生固氮特性,本论文对沙棘根瘤弗兰克氏菌的分 离培养条件及其系统发育地位进行了初步的研究,主要的实验结果如下:
(1)沙棘根瘤弗兰克氏菌的系统发育地位。采集不同生态环境不同沙棘品种 的根瘤,从根瘤内直接扩增 DNA,共得到 39 条根瘤内生菌的 16SrDNA 序列, 属于 20 个单倍型,其中磴口沙棘根瘤内生菌的 16SrDNA 序列有 19 条,属于 4 个单倍型,孙吴的根瘤内生菌的 16SrDNA 序列有 20 条,属于 16 个单倍型,两 个地区间的根瘤内生菌没有共享的单倍型,不存在基因交流。基于基因库中下载 的和沙棘根瘤扩增的 16SrDNA 序列构建系统发育树,将不同地域、不同宿主来 源的弗兰克氏菌分为 4 个明显的分支,包括胡颓子侵染组、杨梅-木麻黄-赤杨侵 染组、非典型菌株和未获得纯培养的根瘤弗兰克氏菌组。其中来自沙棘根瘤的内 生菌以 52%的支持率全部聚在了胡颓子侵染组,均属于弗兰克氏菌。
(2)沙棘根瘤内生菌的分离、培养。实验选取新鲜幼嫩的沙棘根瘤,采用 BAP 培养基和 QMOD 培养基,经根瘤匀浆法和切片法从表面消毒的根瘤中分离 根瘤内生菌,经纯化得到 18 个纯培养菌株,其中通过切片法分离到 14 株,匀浆 法得到 4 株。研究发现,根瘤切片法、BAP 培养基及液体培养的方式更适合沙 棘根瘤内生菌的分离,液体培养能有效的分离菌株,菌落出现时间比固体分离早 7-10 天左右。
(3)沙棘根瘤纯培养菌株的形态特征和分子鉴定。从沙棘根瘤中分离的 18 株纯培养菌株除了 JYY61、JYY62,其余都具有发达的气生菌丝,在显微镜下所 有菌株都有分支状的菌丝,但没有弗兰克氏菌典型的泡囊及孢子囊结构,均不属
I
于弗兰克氏放线菌。根据基内菌丝和气生菌丝发育情况、菌丝与培养基结合程度、
液体培养是否产生菌膜以及菌丝有无隔膜、孢子分化等形态培养特征,将来自沙 棘 根 瘤 的 18  个 菌 株 分 为 两 类 , 并 初 步 判 定 第 一 类 菌 株 属 于 诺 卡 氏 菌 属
(Nocardia),第二类菌株属于小单孢菌属(Micromonospora)。基于网上下载和 实验得到的 16SrDNA 基因序列构建的系统发育树(NJ 树和 MP 树),18 株非 弗兰克氏放线菌被分为明显的两个分支,分别属于诺卡氏菌属分支和小单孢菌属 分支,16SrDNA  基因序列分析的系统分类结果支持基于菌株形态培养特征划分 的两个类群。 关键词:沙棘,根瘤,弗兰克氏菌,非弗兰克氏放线菌,系统发育
II
Abstract
Hippophae rhamnoides L. Elaeagnaceae is a pioneer plant in the northern semi-arid region of China. The root of Hippophae rhamnoides can fix nitrogen from atmosphere for plant growth in symbiosis with Frankia. This species has a wide adaptability and c
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