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- 2018-08-11 发布于福建
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ABI 7500与TL 988实时荧光PCR仪性能评价
ABI 7500与TL 988实时荧光PCR仪性能评价
[摘要] 目的 探讨ABI 7500与TL 988荧光定量PCR仪之间的性能差异。 方法 参照EP9-A2文件中的评价标准,两台仪器分别对5种不同浓度的甲型流感病毒阳性质控品进行检测,每个浓度测量20次,比对两种仪器的精密度、灵敏度,并评价两台仪器结果一致性。 结果 精密度:TL 988的变异系数(CV)从0.68%到1.52%,ABI 7500的CV从1.93%到2.69%。两台仪器在检测高浓度的甲型流感病毒DNA时(107、106、105 copies/mL)差异无统计学意义(P0.05),检测低浓度的病毒DNA时(104、103 copies/mL)差异有统计学意义(P0.05)。灵敏度:两种仪器检测浓度103 copies/mL时,TL 988阳性检出率为100%,ABI 7500检出率为0。两种仪器检测数据相关性良好(r=0.998)。结论 荧光定量TL 988 PCR仪器的性能(精密度和灵敏度)比ABI 7500好。
[关键词] 荧光定量PCR仪;比对;精密度;灵敏度;一致性
[中图分类号] R446.1 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701(2015)02-0155-02
根据ISO 15189要求,实验室需要定期对使用的仪器进行性能评估,当实验室使用两套及以上检测系统检测同一项目时,应比对数据表明其检测结果一致性。现笔者按EP9-A2文件要求[1-5],对美国ABI 7500和国产TL 988的主要性能指标进行评估,以了解结果差异性与一致性,从而寻找国产仪器可替代国外产品的可能性。
1材料与方法
1.1材料
(1)主要仪器:ABI 7500和TL 988荧光定量PCR仪、生物安全柜、低温高速离心机、超净工作台等。
(2)试剂:上海之江生物科技有限公司提供的甲型流感病毒荧光定量PCR检测试剂盒。检测标本:阳性定量质控品(含甲型流感病毒DNA的浓度为107 copies/mL),用free H2O准确10倍比稀释成106、105、104、103 copies/mL,充分混匀,分装250 μL到1.5 mL的eppendorf管中备用。
1.2 方法
1.2.1 精密度测定 按NCCLS标准,分别在ABI 7500和TL 988荧光定量PCR仪上同时检测107、106、105、104 copies/mL四种浓度的阳性质控品。各浓度均测定20次,计算其均值、标准差和变异系数。
1.2.2 灵敏度测定 分别取107、106、105、104、103 copies/mL五个浓度标本在两台PCR仪上进行检测,根据阳性检测率分析其灵敏度。
1.2.3相关性检测 通过重复性试验中的数据,分别取107、106、105、104 copies/mL浓度的检测结果的平均值,分析两台仪器的数据相关性。
1.3统计学方法
应用SPSS 17.0统计学软件对数据分析处理。检查是否有离群值,对数据进行初步检查,两变量间线性关系分析采用直线相关及回归分析。P0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1两台仪器精密度结果比较
TL 988 和ABI 7500两台荧光PCR仪器的精密度结果比较,见表1。可以看出TL 988测得各浓度数据的变异系数(CV)从0.68%到1.52%,ABI 7500测得各浓度数据的变异系数(CV)是从1.93%到2.69%,变异系数(CV)均在要求范围内(0.05)。此外,关于相同浓度的标准品检测结果的Ct值和标准差分析,显示两台PCR仪的批内重复性均良好。
表1 两台仪器精密度结果比较
2.2两台仪器灵敏度结果比较
甲型流感病毒DNA的浓度在107、106、105、104 copies/mL时,两台仪器的阳性检出率均为100%,当浓度为103 copies/mL时,TL 988检出率依然为100%,但ABI 7500的检出率为0。灵敏度方面,TL988要比ABI 7500能检测到更低浓度,即灵敏度相对较高(P0.05)。
2.3 相关性比较
两台仪器对各标本的甲型流感病毒DNA的含量进行测定,结果表明,两台仪器测定值的回归直线方程为:y=1.2364x-5.2097(r=0.998),具有良好的直线相关和回归关系。
3 讨论
在2013年全球高科技产业值中,精密仪器医疗设备约为3万亿美金,占13%。而精密医疗设备基本上被国外所垄断。医疗设备是现代医疗业发展的必备手段,所以需要加快精密仪器的国有化进程,降低成本,推动民族品牌企业不断发展,降低老百姓就医费用成本。
荧光定量PCR技术是通过荧光染料或荧光
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