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SSR分子标记在玉米育种中研究进展 　　摘要 简要介绍了SSR分子标记的原理及特点，综述了近年来SSR分子标记在玉米遗传多样性分析、杂种优势群的划分、品种纯度及真伪鉴定、遗传连锁图谱的构建及基因定位、单倍体育种、分子标记辅助选择育种中的研究进展及应用前景，以期为SSR分子标记技术在作物育种中的应用提供参考。 　　关键词 SSR；分子标记；玉米；遗传育种 　　中图分类号 S513 文献标识码 A 文章编号 1007-5739（2016）07-0015-02 　　Abstract The principle and characteristics of SSR molecular marker were simply introduced，the research advances and application prospect of SSR molecular marker in maize breeding were summarized in past years，such as the analysis of genetic diversity，division of heterosis groups，the detection of the hybred purity and its authenticity，construction of genetic spectrum and gene locating，haploid breeding and selection breeding assisted by molecular markers，in order to provide reference for the application of SSR molecular markers in crop breeding. 　　Key words SSR；molecular markers；maize；genetic breeding 　　在传统的培育玉米的过程中，选择的依据常为表型的性状，由于受环境等多方面的影响，该依据效率不高，有很多缺点。最佳的方法应该是对决定目的性状的基因型直接进行有目的地选择，可以大大提高育种的效率，分子标记技术为实现对基因型的直接选择提供了可能。 　　SSR分子标记主要用于遗传多样性分析、杂种优势群的划分、品种（杂种）纯度及真伪鉴定、遗传连锁图谱的构建及基因定位、单倍体育种、分子标记辅助选择育种等方面。 　　1 SSR分子标记的原理及特点 　　SSR序列即为简单重复序列，也称微卫星DNA，其核心的序列由1～6 bp串联重复在一起，在农作物中最常见的二核苷酸重复单位是（AC）n和（GA）n，每个SSR序列的核心序列具有相同的结构，一般重复单位为10～60个，其不同数目的重复单位串联在一起，是形成高度多态性的主要原因。SSR标记的基本原理：在进行引物的设计时，要结合位于微卫星序列两端的互补序列进行，采用PCR反应技术，对微卫星片段进行扩增，由于核心序列具有不同的串联重复数目，因此使用PCR可以将长度各不相同的PCR产物扩增出来，然后进行凝胶电泳，以对核心序列的长度多态性进行分析。 　　与其他分子标记相比，SSR分子标记的优点包括[1-3]：等位基因数量多；所需DNA数量及质量要求不高；覆盖整个基因组、数量丰富；遗传呈现共显性，不易被自然选择和人工选择所淘汰；多态性高、试验程序简单、安全高效、结果重复性好；缺点是在采用SSR技术对微卫星DNA多态性进行分析时，必须要对重复序列两端DNA序列的信息进行了解。如在DNA数据库中不能直接地查到，则应该先进行测序。 　　2 SSR分子标记在玉米育种中的研究进展 　　2.1 遗传多样性分析 　　能够以群体中某一位点等位基因数、每个位点的平均等位基因数、多态信息量等揭示其变异规律，评价种质的遗传多样性，成为分析玉米遗传多样性的主要手段。Smith等[4]开展了玉米遗传多样性的研究，选择了131对SSR引物，它们来自不同的种质类群，其聚类结果与已知的系谱分析基本吻合。刘志斋等[5]利用覆盖玉米全基因组的40个核心SSR标记对820份代表中国玉米育种资源种质基础的自交系进行全基因组扫描，揭示其遗传多样性与群体结构。聚类分析将这些自交系划分成5个类群，蕴含了比较丰富的遗传变异。朱 英等[6]利用SSR标记对21份贵州玉米优质种质资源进行遗传多样性分析，多态性丰富的20对SSR 引物共检测出97个基因变异，每对引物检测到等位基因2～11个，平均4.85个，多态性信息量（PIC）介于0.19～0.78，平均为0.53。UPGMA聚类分析表明，供试材料间遗传距离变幅为0.22～0.63，平均为0.43。王凤格等[7]利用均匀分布于玉米基因