低温处理后不同竹种cDNA分子水平上变化和聚类分析.docVIP

低温处理后不同竹种cDNA分子水平上的变化和聚类分析 　　摘要：以慈竹和硬头黄竹等１２个竹种为材料，采用ＲＡＰＤ－ＰＣＲ方法，研究低温胁迫后不同竹种ｃＤＮＡ分子水平上的变化。结果是低温处理后，不同竹种的ｃＤＮＡ经不同引物扩增后，其ＲＡＰＤ－ＰＣＲ谱带的变化出现４种类型，即有的竹种出现原有ＲＡＰＤ－ＰＣＲ谱带的缺失、新谱带的出现以及原有谱带强度的增强和减弱，有的竹种ＲＡＰＤ－ＰＣＲ谱带未发生改变，这表明低温处理后不同竹种在分子水平上确实发生了变化，这种变化与低温胁迫有关，且因竹种而异。 　　关键词：竹；低温胁迫；ｃＤＮＡ水平变化；聚类分析 　　中图分类号：Ｓ７９５ 文献标识码：Ａ 文章编号：0439－８114（２０11）07－1484-04 　　 　　Variation and Clustering Analysis about cDNA of Bamboo Treated by Cold 　　 　　ＨＵ Ｓｈａｎｇ－ｌｉａｎ１，ＣＡＯ Ｙｉｎｇ１，ＤＵＡＮ Ｎｉｎｇ１，ＬI Ｙｉ１，ＣＨＥＮ Ｑｉ－ｂｉｎｇ２，ＬＵ Ｘｕｅ－ｑｉｎ１，ＪＩＡＮＧ Ｙａｏ１，２ 　　（１． Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｓｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｍｉａｎｙａｎｇ ６２１０１０，Ｓｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ； 　　２． Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ａｎｄ Ｈｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｃｏｌｌｅｇｅ，Ｓｉｃｈｕａｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｙａ’ａｎ ６２５０１４，Ｓｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ） 　　 　　Ａｂｓｔｒａｃｔ： Ｔｈｅ ｃｈａｎｇｅｓ ｏｆ ＲＡＰＤ－ＰＣＲ ｐａｔｔｅｒｎｓ ａｎｄ ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃＤＮＡ ｆｒｏｍ ｔｗｅｌｖｅ ｂａｍｂｏｏ ｓｐｅｃｉｅｓ， ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ Ｎｅｏｓｉｎｏｃａｌａｍｕｓ ａｆｆｉｎｉｓ ａｎｄ Ｂａｍｂｕｓａ ｒｉｇｉｄａ ｅｃｔ．， ｕｎｄｅｒ ｔｈｅ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎ ｏｆ ｌｏｗ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ｗｅｒｅ ｓｔｕｄｉｅｄ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅ ｃｈａｎｇｅｓ ｏｆ ＲＡＰＤ－ＰＣＲ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｔｈｅ ｃＤＮＡ ｄｉｆｆｅｒｅｄ ｆｒｏｍ ｓｐｅｃｉｅｓ ｔｏ ｓｐｅｃｉｅｓ． Ｃｏｍｐａｒｅｄ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ｃｏｎｔｒｏｌ， ｔｈｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｄｅｌｅｔｉｏｎ ｏｒ ａｐｐｅａｒａｎｃｅ ｏｆ ｎｅｗ ｏｆ ＲＡＰＤ－ＰＣＲ ｂａｎｄｓ， ｓｔｒｅｎｇｔｈｅｎｉｎｇ ｏｒ ｗｅａｋｅｎｉｎｇ ｏｆ ＲＡＰＤ－ＰＣＲ ｂａｎｄｓ ｗｅｒｅ ｆｏｕｎｄ． Ｈｏｗｅｖｅｒ， ｎｏ ｃｈａｎｇｅ ｏｆ ＲＡＰＤ－ＰＣＲ ｂａｎｄｓ ｗａｓ ｆｏｕｎｄ ｉｎ ｓｏｍｅ ｓｐｅｃｉｅｓ． Ｔｈｅ ｐａｔｔｅｒｎ ｃｈａｎｇｅｓ ｏｆ ＲＡＰＤ－ＰＣＲ ｂａｎｄｓ ｗｅｒｅ ｒｅｌａｔｅｄ ｔｏ ｔｈｅ ｌｏｗ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ｓｔｒｅｓｓ ａｎｄ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｂａｍｂｏｏ ｓｐｅｃｉｅｓ． 　　Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ： ｂａｍｂｏｏ；ｌｏｗ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ｓｔｒｅｓｓ；ｃｈａｎｇｅｓ ｏｆ ｃＤＮＡ；ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ ａｎａｌｙｓｉｓ 　　 　　在低温胁迫下植物体内的可溶性糖［１］、可溶性蛋白质和游离脯氨酸、保护酶活性［２］等常发生变化。以往对竹子抗寒性的研究，主要集中在自然条件下与竹子抗寒性有关的生理生化指标的分析上［３－６］，而分子水平的变化鲜见报道，本文以慈竹、硬头黄竹等１２种竹子为材料，采用ＲＡＰＤ－ＰＣＲ技术，研究低温胁迫后不同竹种ｃＤＮＡ水平上的变化，为竹子抗寒机制的研究提供理论依据。 　　１材料与方法 　　１．１材料 　　供试材料采自四川青神竹艺城，分别为慈竹（Ｎｅｏｓｉｎｏｃａｌａｍｕｓ ａｆｆｉｎｉｓ，以ＣＺ表示）、硬头黄竹（Ｂａｍｂｕｓａ ｒｉｇｄａ，以ＹＴＨ表示）、小琴丝竹（Ｂａｍｂｕｓａ ｍｕｌｔｉｐｌｅｘ ｖａｒ． ｍｕｌｔｉｐｌｅｘ ｃｖ． Ａｌｐｈｏｎｓｅ－Ｋａｒｒ，以ＸＱＳＺ表示）、青皮竹（Ｂａｍｂｕｓａ ｔｅｘｔｉｌｉｓ ＭｃＣｌｕｒｅ，以ＱＤＺ表示）、粉单竹（Ｂａｍｂｕｓａ ｃｈｕｎｇｉｉ ＭｃＣｌｕｒ，以ＦＤＺ表示）、钓鱼竹（Ｐｈｙｌｌｏｓｔａｃｈｙｓ ｎｉｇｒａ ｖａｒ． ｈｅｎｏｎｉｓ Ｓｔａｐｆ． ｅｘ Ｒｅｎｄｌｅ，以ＤＹＺ表示）、罗汉竹（Ｐｈｙｌｌｏｓｔａｃｈｙｓ ａｕｒｅａ Ｃａｒｒ．ｅｘ Ａ． ａｎｄ Ｃ．Ｒｉｖｉｅｒｅ，以ＬＨＺ表示）