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南极多环芳烃低温降解菌筛选及其降解特性研究
南极多环芳烃低温降解菌筛选及其降解特性研究
摘要 从南极嗜冷菌中筛选出1株降解多环芳烃的菌株NJ49,采用16S rRNA分子鉴定方法鉴定其属于希瓦氏菌属(Shewanella)。其降解特性研究表明:它可以在以萘为唯一碳源和能源的无机盐培养基中生长,在5℃低温环境中降解多环芳烃,这可为我国低温养殖海域多环芳烃的清除提供新的途径。
关键词 南极低温菌;多环芳烃;筛选;降解特性
中图分类号 X172文献标识码A文章编号1007-5739(2008)19-0264-02
多环芳烃(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)是环境中持久存在的污染物,是重要致癌污染物之一。这种有毒的化学物质遍布于海洋环境,有的被生物体吸收,有的附着在生物体上,有的存在于水体中,因而构成了海洋中的一类特殊的污染物。这类物质可为某些海洋生物所富积或贮存,并经食物链进入人体。我国养殖海域的PAHs污染比较严重,这不仅影响到该海域的生物多样性,也影响到养殖业的发展和水产品的食用安全[1]。
研究表明微生物降解是环境中多环芳烃去除最主要的途径[2]。目前,对于我国养殖海域PAHs的微生物降解研究日益增多,但主要集中在常温微生物降解PAHs的研究,对低温微生物降解PAHs研究较少。我国黄海和渤海海域的冬春季水温较低,常温微生物很难清除低温海域的PAHs,因此研究低温微生物对PAHs的降解具有重要意义。本文从南极海洋低温菌中筛选得到1株能降解萘的低温菌NJ49,并对其低温降解特性进行了初步研究,以期为我国低温养殖海域PAHs的清除提供新的技术途径。
1材料与方法
1.1菌株
南极细菌菌种是从2002~2003年南极第19次科学考察所采南极海水、海冰和海泥中分离纯化得到的,现存放于国家海洋局海洋生物活性物质重点实验室。
1.2培养基
分离纯化培养基为2216E固体:蛋白胨5g;酵母粉1g;用过滤陈海水定容至1 000mL,pH值7.0~7.5,121℃下湿热灭菌20min。
筛选培养基为人工海水培养基(MMC)[3],灭菌后补加适量微量元素混合液;并补以萘作为唯一碳源,萘及微量元素经0.2μm滤膜过滤除菌。
1.3生长曲线测定
将待测菌株在2216E培养基中,5℃、120rpm低温摇床振荡培养7d。移取5.0mL活化的菌液,用无菌MMC在6 000rpm下离心5min,洗涤2次,取菌体接入装有100mL以萘为唯一碳源的MMC液体培养基中,于5℃、120rpm下振荡培养,每隔24h取样1次,以未接菌的MMC液体培养基做空白,用分光光度计测540nm的吸光值(OD540)。以培养时间为横坐标、OD540为纵坐标绘制生长曲线。
1.4萘降解能力的测定
移取5.0mL活化的菌液,加入到100mL萘初始浓度为200 mg/L的MMC液体培养基中,在5℃、120rpm上摇床振荡培养10d,每24h取样1次。取出的培养液中加入等体积环己烷,剧烈振荡10min后,萃取萘,用适量环己烷稀释待测萃取液,在275nm处以环己烷为参比测定其吸光度,根据萘-环己烷标准曲线计算萘的质量浓度。
1.5菌种鉴定
按照CTAB方法提取细菌总DNA[3],采用细菌16S rDNA的通用引物PCR扩增16S rDNA,构建16S rDNA文库,完成16S rDNA序列测定与系统进化关系的分析。
2结果与分析
2.1南极萘降解低温菌的筛选
将385株南极嗜冷菌在以萘为唯一碳源的MMC液体培养基中培养,从中筛选到1株生长旺盛的芳香烃降解菌,编号为NJ49。南极低温菌NJ49能以萘为唯一碳源进行生长,且生长态势良好。
2.2南极低温菌NJ49在萘培养基中的生长曲线
南极低温菌NJ49在萘培养基中的生长曲线如图1。南极低温菌NJ49在萘培养基中培养11d后达到指数生长期,并逐渐进入稳定期,此时南极低温菌NJ49细胞数量达到最高峰,生长与死亡处于一个动态平衡中。第12天后,由于培养基中的营养基本被消耗,生长速率小于死亡速率,细菌数量开始减少,进入衰亡期。
2.3南极低温菌NJ49对萘的降解活性
南极低温菌NJ49对萘的降解率如图2。随着时间的推移,南极低温菌NJ49对萘的降解率不断增大。降解前期,降解率缓慢增大,第7天的降解率为17%;在第8天降解率明显提高,为44%;第13天达到最高,为66%。
2.4南极萘降解菌NJ49的分子鉴定
对南极萘降解菌NJ49的16S rRNA基因序列的相似性进行比较,菌株NJ49序列同Shewanella frigidimarina,Shewanella
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