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南瓜种质资源农艺性状主成分及聚类分析
南瓜种质资源农艺性状主成分及聚类分析
摘 要:对37份南瓜种质资源主要农艺性状进行主成分分析和聚类分析。分析结果表明,南瓜种质27个农艺性状变异系数幅度为5.50%~69.44%,平均变异系数为26.86%,Shannon多样性信息指数平均值为1.667,老瓜纵径
Shannon多样性信息指数最高,为2.273;瓜面特征最低,为0.785。综合来看,数量性状多样性信息指数要高于质量性状;主成分分析结果显示,第1、第2、第3主成分的方差贡献率分别为20.89%、13.64%和10.28%,累积贡献率44.81%;聚类分析结果表明,可以将37份南瓜种质分为三大类,其中第1类1份材料,第2类也为1份材料,其余为第3类,共35份材料。
关键词:南瓜;种质资源;农艺性状;主成分分析;聚类分析
南瓜属(Cucurbita)是一个大族群,起源于中、南美洲[1],包括5个栽培种:中国南瓜(Cucurbita moschata)、美洲南瓜(C. pepo)、印度南瓜(C. maxima)、灰籽南瓜(C. mixta)和黑籽南瓜(C. ficifolia)。有研究表明,南瓜营养丰富,富含南瓜多糖、抗坏血酸、β-胡萝卜素等,同时保健药用价值高,具备显著降脂、降糖、防癌、抗癌等功效 [2,4]。据联合国粮农组织(FAO)数据统计显示,2011年世界南瓜种植面积约为177万 hm2,产量约2 430万 t。中国和印度均为南瓜属作物主产国,中国南瓜栽培面积约37万 hm2,位居世界第2位,仅次于印度(51万hm2);中国南瓜总产量约697万t,位居世界第1位。
植物遗传多样性的研究是种质资源创新和品种改良的基础,研究种质间的亲缘关系和系统分类具有重要意义。利用分子标记技术和同工酶分析对植物种质资源进行评价、鉴定和分类在南瓜属植物中已有报道[5~8],然而形态学水平的评价和鉴定仍是种质资源研究最古老、最直接、最简便的途径和方法,不可忽视。本试验以37份南瓜种质为材料,对其27个农艺性状进行观察记录和评价,采用主成分分析及聚类分析,为南瓜种质资源的收集、保存、鉴定、创新和开发利用提供科学依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
供试南瓜种质材料共37份,均由云南省农业科学院园艺作物研究所龙荣华老师提供,其编号、来源地见表1,除4份材料为商品种外,其余均为云南的地方资源。
1.2 试验方法
所有供试材料于2010年种植于云南省农业科学院热区生态农业研究所蔬菜研究基地。随机区组设计,每小区定植10株,3次重复。采用白色地膜覆盖栽培、滴管灌溉,单行种植、爬地栽培、自交授粉,常规栽培管理。试验数据观察记录参考《南瓜种质资源描述规范和数据标准》[9],每小区随机选取5株,共记录7个质量性状和20个数量性状。
1.3 数据处理与分析
质量性状依据《南瓜种质资源描述规范和数据标准》进行赋值(表2)。数量性状按照原始数值进行统计分析。对南瓜种质27个农艺性状赋值后,采用SAS 9.0软件对平均值、最小值、最大值、极差、标准差及变异系数等基本统计量进行分析。
在计算Shannon多样性信息指数之前,先对数量性状进行分级,共分为10级,1级lt;X-2s,10级gt;X+2s,中间每级间隔0.5s,X代表平均值,s代表标准差。Shannon多样性信息指数I=-■P■lnP■,其中,Pi代表1个农艺性状有s个不同类型,第i个类型个体数目在总个体数目中所占的比率。
1.4 主成分分析与聚类分析
对37份南瓜种质资源的27个形态学性状的数据进行标准化处理,采用SAS 9.0统计软件中的PRINCOMP过程进行主成分分析,再采用SAS 9.0软件中的类平均法(UPGMA)进行系统聚类分析。
2 结果与分析
2.1 南瓜种质农艺性状的基本统计量分析
37份南瓜种质的27个农艺性状基本统计量分析结果表明,不同种质之间变异较大,各性状在不同种质之间呈现不同程度的遗传多样性(表3)。27个性状中,瓜形变异系数最大,为69.44%,全生育期变异系数最小,仅为5.50%,平均变异系数为26.86%。
①植株性状 南瓜种质植株性状平均变异系数为21.38%。叶片宽8.10~36.30 cm,变异系数最大(32.65%);其次为第1雌花节位(30.46%)。
③果实性状 南瓜种质果实性状平均变异系数为32.82%,表明南瓜在果实性状方面多样性程度较高。参试材料瓜形共有8种,变异系数最大,为69.44%;其次为老瓜肉色,为49.37%;嫩瓜皮色变异系数最小,为12.10%。
②种子性状 南瓜种质性状平均变异系数为21.
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