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基于共现分析冠心病不稳定性心绞痛血瘀证异常指标网络构建
基于共现分析冠心病不稳定性心绞痛血瘀证异常指标网络构建
[摘要] 目的 以冠心病不稳定性心绞痛血瘀证为例,探讨文献挖掘法挖掘证候生物学指标的可行性。 方法 采用文献挖掘的“共现”分析法挖掘出冠心病不稳定性心绞痛血瘀证的特异指标,然后与临床检测出的血瘀证特异指标进行比较,最后对两种方法的结果进行一致性检验。 结果 通过文献挖掘并筛选得出特异临床指标30个,通过临床检验得出特异指标15个。两种结果相比较,Kappa值为0.41,一致性率为84.5%。 结论 文献挖掘法作为一种新的发现证候异常生物学指标的方法具有一定的可行性,建议进一步优化算法并将其扩大到其他证型的研究中。
[关键词] 血瘀证; 冠心病不稳定性心绞痛;文献挖掘;生物学指标
[中图分类号] R259.414 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210(2014)12(b)-0138-04
冠心病是中老年人的常见病,是因冠状动脉粥样硬化导致血管腔狭窄致使心肌缺血、缺氧而引起的心脏病[1]。对于冠心病的形成因素,许多学者都对此做过比较深入的研究。毛静远等[2]对冠心病辨证分型的相关文献进行分时段研究,认为冠心病相关证候要素(证素)以血瘀、气虚、痰浊、阴虚、气滞、阳虚为多见。白文红等[3]经研究认为,冠心病不稳定型心绞痛的主要病机为气虚血瘀。毕颖斐等[4]通过对华北平原5省市的1007例冠心病心绞痛患者进行临床横断面实地调查,证素组合以气虚+血瘀最为常见。张琳等[5]以“冠心病AND证”为关键词在文献中进行统计分析,结果显示冠心病心绞痛证候分布频率由高至低依次为:血瘀、气虚、痰浊、阴虚、气滞、阳虚、寒凝、热蕴。罗良涛等[6]对915例患者证素分布进行描述性统计分析并探讨其分布规律。结果显示,冠心病患者总体病性证素分布以气虚、血瘀、水饮、阴虚、痰浊、阳虚为主。由此可知,“血瘀证”是一种被大多数研究者所公认的冠心病常见证候。
在生物医学领域,文本挖掘的主要任务是对海量生物医学数据进行整合、分析,从中挖掘出来实验假设和实验建议,以便生物学家验证得到新的科学发现,从而提高人们对生物医学现象的认识[7]。Swanson教授[8]首先在MEDLINE 的生物医学文献中发现了诸如镁缺失与偏头痛的医学关系,成为了文本挖掘的开创性研究者。李梢[9]将文本挖掘应用在中医学领域,初步证明了“病”与“证”在生物网络的层面上,具有“病证结合”的可行性。由此可见,在现代生物医学研究中,文本挖掘技术起着越来越重要的作用。
本研究以冠心病的常见证候“血瘀证”为例,应用文献挖掘技术构建冠心病不稳定性心绞痛血瘀证的特异性生物学指标网络,并且使用临床病例资料对文献研究结果进行比较,探讨文献挖掘方法的准确性和可靠性,为证候客观化研究提供一种新的研究思路和方法。
1 资料与方法
1.1 构建“血瘀证”相关文献的文献库
收集并整理“血瘀证”相关术语[瘀血内阻(Blood stasis);血行不畅(Poor blood);局部出现青紫肿块(Blue mass);疼痛(The pain);拒绝按压(Refused to press);腹内?Y块(Intra-abdominal disease block);刺痛(Sting);出血紫暗成块(Hemorrhage into a dark purple);舌紫(Purple tongue);舌有斑点(The tongue has spots);脉弦(Pulse string);脉涩(Pulse acerbity)],收集标准依据《中华人民共和国国家标准中医临床诊疗术语》,再分别以这些术语和以冠心病不稳定性心绞痛相关术语(Coronary heart disease、Unstable angina pectoris、CHD、UAP)为关键词在PubMed数据库(http:///pubmed)中进行搜索,下载文章的标题或摘要中含有这些关键词的文献摘要,共下载到可能与冠心病不稳定性心绞痛血瘀证相关的文献5041篇,以“xml”格式保存,然后对下载的文件进行数据清洗和整理,构建冠心病不稳定性心绞痛血瘀证相关文献的文献库。文献搜索和下载完成时间为2014年11月2日,结果以完成当天的数据为准。
1.2文献挖掘
“共现原则”是指如果在大量文献中,两个词经常共同出现在同一语句或段落中,则认为这两个词在语义上是相互关联的[10]。本文以在前期流行病学调查过程中收集的149项常用的临床常规指标为探针,应用笔者前期开发的文献挖掘软件(PubMed Miner)对冠心病不稳定性心绞痛血瘀证文献库中的文献进行扫描,使用“共现原则”构建生物学指标网络。文献挖掘过程见图1。
1.3 临床数据来源
在前期的工作中笔者
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