中国柳穿鱼自然居群的遗传多样性分析-Genetic Diversity Analysis of Natural Populations of Sciaenops ocellatus in China.docxVIP

I I 缩略中英文对照表 英文缩写 英文全称 中文名称 RFLP Restrietion fragment length polymohisms 显著性内切酶片段长度 多态性 RAPD random amplified polymorphic DNA 随机扩增的多态DNA SSR Simple Sequence Repeats 微卫星DNA（简单重复 序列） ISSR Inter simple Sequenee Repeat 简单重复间序列 SSCP Single-Strand Conformation Polymor-phism 单链构想多态性 AMD Amplified and mismatch detection 扩增和错配对检测 cpDNA chloroplast DNA 叶绿体DNA mtDNA Mitochondrial DNA 线粒体DNA SCAR Sequence characteristic amplified region 序列特征扩增区 CAPS Cleaved amplified polymorphic sequence 切割扩增多态序列 APGⅡ Angiosperm phylogeny Group Ⅱ 被子植物种系发生学组Ⅱ SI Self-incompatibility 自交不亲和 SC Self-compatibility 自交亲和 IR inverted repeat sequence 反向重复序列 LSC Large single-copy region 大单拷贝区 SSC small single-copy region 小单拷贝区 rbcL trnL-F Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase oxygenase L Intergenic regions between trnL-F 二磷酸核糖单加氧酶 大亚基 trnL和trnF基因间隔区 rps4-trnS Intergenic regions between rps4-trnS rps4和trnS基因间隔区 trnS-trnG Intergenic regions between trnS-G trnS和trnG基因间隔区 trnT-trnL Intergenic regions between trnT-L trnT和trnL基因间隔区 trnQ-5’rps16 Intergenic regions between trnQ-5’rps16 trnQ和5’rps16基因间隔区 rpl32-trnL Intergenic regions between rpl32-trnL rpl32和trnL基因间隔区 II II 摘要 柳穿鱼属（Linaria Mill）植物在我国北方地区广泛分布，是重要的药用植 物及园林绿化观赏植物。柳穿鱼（L. vulgaris）是一个广泛分布种，繁育策略通 常为强制异交，这在很大程度上决定了柳穿鱼自然群体具有较高的遗传多样性水 平。本研究采用随机扩增多态 DNA（RAPD）技术，用 10 个随机引物对我国四 个柳穿鱼自然居群进行 PCR 扩增，旨在探讨柳穿鱼自交不亲和的繁育系统及不 同生境对居群遗传多样性水平高低的影响，为合理开发利用柳穿鱼的自然资源提 供理论基础。同时，为了克服 RAPD 分子标记偶然性高和重复性差等不足，本 研究选取物种水平变异较快的 4 个叶绿体基因组 DNA（cpDNA）片段，在柳穿 鱼 4 个自然群体中进行序列分析和筛选，旨在为下一步针对柳穿鱼的大规模遗传 多样性研究提供更有力的分子工具。本研究的主要结果如下： 1. 10 个 RAPD 随机引物对 4 个分布于黄土高原和华北平原的柳穿鱼居群扩增 出的 88 个位点中有 79 个多态位点，多态位点百分率（PPB）为 89.77%。通过 POPGENE 软件计算得到 Nei’s 基因多样性（h）为 0.244，Shannon’s 多态性信息 指数（I）为 0.388。以上三个遗传参数表明柳穿鱼具有较高的居群内遗传多样性 水平。通过 POPGENE 分析遗传变异在居群间的分布情况，结果表明，柳穿鱼的 基因分化系数（Gst）为 0.138，表明柳穿鱼的遗传变异主要存在于居群内。已有 研究表明柳穿鱼属及其近缘的金鱼草植物中自交不亲和类群的 Gst 分别为 0.03 和 0.13，具有较高的居群内遗传多样性和较低的居群间遗传多样性，相反，自交 亲和材料的 Gst 分别为 0.882 和 0.52。本研究获得的 RAPD 分子数据支持我们关 于自交不亲和的繁殖特性促使柳穿鱼自然群体内部具有较高的遗传多样性水平， 而居群之间遗传分化较小的假设，也与人工杂交试验发现 4 个居群中大部分为自 交不结实的遗传学研