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Platform HPC的应用模板定制

Platform HPC的应用模板定制   摘 要:本文探讨如何在Platform HPC界面下定制非集成的应用程序模板,让所有只关注计算的用户能够透明地利用您的集群,使其无需任何集群专业知识而顺利完成计算任务,同时也为运维Platform HPC的管理人员提供参考。   关键词:Platform HPC;仿真分析;高性能计算集群;应用程序模板;LSF BSUB ACTRAN   中图分类号:TP393.01   名词解释 Platform HPC:即Platform 公司推出的高性能计算集群系统。模板:这里指HPC界面下为仿真分析应用软件提供的配置脚本,管理人员可以通过定制或修改脚本,满足自己要求。LSF:Platform公司开发的作业调度软件。BSUB:LSF下提交作业的执行程序。ACTRAN:仿真分析软件。   Platform HPC是一个高性能计算集群套件,它包好LSF作业调度系统、PMC Web门户界面,各行业的仿真分析用户能够通过WEB界面部署、管理集群和完成作业调度,使其专注于计算,而不是基础架构。Platform HPC界面包含主流仿真分析应用的作业模板,简化了应用程序集成,并使您能够透明地利用您的集群,提高应用程序工作负载。但还有众多的应用软件没有被集成,只能使用命令行提交作业,无法利用Web界面的优势,阻碍用户的普及率。下面就探讨如何定制作业模板,把所有仿真分析应用集成进Web门户,提高用户的使用率。   1 Platform HPC作业提交模板   定制Platform HPC作业提交模板,有两种方式:   (1)编写自己的模板脚本,使其满足新应用程序要求。这种方式需要熟练掌握脚本语言和了解Platform HPC界面接口,适合商业应用公司来开发、定制复杂应用。   (2)简单调整、定制现有应用程序的模板,使其适用于其它应用。这种方式适合有读和简单编写脚本程序能力,大多数的HPC管理人员,这里就采用此方式来实现。   以编写Actran软件作业提交模板为例:选择Platform HPC界面集成的Abaqus应用程序模板,另存为Actran模板。图形编辑新生成的模板,结果如下图1:   图1   定制ACTRAN模板提交脚本。部分内容如下:   (1)应用程序参数   #Actran软件路径及变量   PATH_OF_PRODUCTLINE=--apl=/FFT/Actran_13.0   #每个计算节点的核数   SPAN=span[ptile=12]   export SPAN   #作业名选项同Abaqus   #内存选项   if [ x$MEMORY != x ] ; then   ACTRAN_OPTIONS=$ACTRAN_OPTIONS -m $MEMORY   fi   #并行选项,空为串行,为ACTRAN特有,也是整个脚本部分的难点   if [ x$PARALLEL != x ]; then   PARALLEL_OPT=--parallel=$PARALLEL   ACTRAN_CMD=actranpy_mp   else   PARALLEL_OPT=   ACTRAN_CMD=actranpy   Fi   #Actran额外选现同Abaqus   (2)集群参数   #提醒选现同Abaqus   #CPU选项   if [ x$NCPU != x ]; then   NCPU_OPT=-n $NCPU   else   NCPU_OPT=   fi   #队列选项   if [ x$QUEUE != x ]; then   SUB_QUEUE_OPT=-q $QUEUE   else   SUB_QUEUE_OPT=   fi   #输入文件及选项,简单替换或修改Abaqus   if [ x$EDAT_INPUT_FILE = x ]; then   echo You must specify an input (.edat) data file to submit an ACTRAN job. 12   exit 1   else   EDAT_INPUT_FILE=`echo $EDAT_INPUT_FILE | tr -d \`   if [ x$ACTRAN_OPTIONS = x ]; then   ACTRAN_OPTIONS=-i \$EDAT_INPUT_FILE\   else   ACTRAN_OPTIONS=$ACTRAN_OPTIONS -i \$INP_INPUT_FILE\   fi   fi   #BSUB执行命令参数组合,注

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