水环境下具有氨基和羧基间双氢键的缬氨酸旋光异构及-中山大学学报.PDF

第５７卷　第 ３期 中山大学学报 （自然科学版） Ｖｏｌ５７　Ｎｏ３ 　 ２０１８年　５月 ＡＣＴＡ　ＳＣＩＥＮＴＩＡＲＵＭ　ＮＡＴＵＲＡＬＩＵＭ　ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＡＴＩＳ　ＳＵＮＹＡＴＳＥＮＩ Ｍａｙ　２０１８　 ＤＯＩ：１０１３４７１／ｊｃｎｋｉａｃｔａｓｎｕｓ２０１８０３０１４ 水环境下具有氨基和羧基间双氢键的 缬氨酸旋光异构及羟自由基致损伤的机理 １ ２ ２ ２ ２ ２ 赵宇 ，汤振宇 ，吴怡 ，张育凯 ，杨晓翠 ，王佐成 （１．白城师范学院计算机科学学院，吉林 白城 １３７０００； ２．白城师范学院物理学院，吉林 白城 １３７０００） 摘　要：在ＭＰ２／６－３１１＋＋Ｇ（２ｄｆ，ｐｄ）／／Ｂ３ＬＹＰ／６－３１＋Ｇ（ｄ，ｐ）双理论水平，采用自洽反应场 （ＳＣＲＦ） 理论的ｓｍｄ模型方法，对标题反应进行了研究。反应通道研究表明：水环境下缬氨酸的旋光异构可以在３个通 道ａ、ｂ和ｃ实现，分别是质子以水分子簇为媒介以氨基氮、羰基氧和羧基为桥梁，从 碳的一侧迁移到另一 α 侧；水分子辅助羟自由基抽氢致缬氨酸损伤发生在ａ通道。势能面计算表明：２个和３个水分子簇作氢迁移媒介 时，水分子簇对旋光异构反应的氢迁移过程有极好的催化作用，使反应能垒相对裸反应大幅降低，水溶剂效应 在ａ通道有较好的助催化作用，对ｂ和ｃ通道影响不大。水分子辅助羟自由基抽氢致缬氨酸损伤气相反应能垒较 低，水溶剂效应对此反应有较大的阻碍作用。 关键词：旋光异构；缬氨酸；密度泛函理论；过渡态；微扰论；溶剂效应；羟自由基；损伤 中图分类号：Ｏ６４１１２　　文献标志码：Ａ　　文章编号：０５２９－６５７９（２０１８）０３－００９６－１２ Ｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆｏｐｔｉｃａｌｉｓｏｍｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆｖａｌｉｎｅｍｏｌｅｃｕｌｅｓ ｗｉｔｈｄｕａｌｈｙｄｒｏｇｅｎｂｏｎｄｓｂｅｔｗｅｅｎａｍｉｎｏａｎｄｃａｒｂｏｘｙｌｇｒｏｕｐｓａｎｄ ｔｈｅｄａｍａｇｅｉｎｄｕｃｅｄｂｙｈｙｄｒｏｘｙｌｒａｄｉｃａｌｓｉｎｗａｔｅｒｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ １ ２ ２ ２ ２ ２ ＺＨＡＯＹｕ，ＴＡＮＧＺｈｅｎｙｕ，ＷＵＹｉ，ＺＨＡＮＧＹｕｋａｉ，ＹＡＮＧＸｉａｏｃｕｉ，ＷＡＮＧＺｕｏｃｈｅｎｇ （１．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＣｏｍｐｕｔｅｒＳｃｉｅｎｃｅ，ＢａｉｃｈｅｎｇＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｂａｉｃｈｅｎｇ１３７０００，Ｃｈｉｎａ； ２．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＰｈｙｓｉｃｓ，ＢａｉｃｈｅｎｇＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｂａｉｃｈｅｎｇ１３７０００，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆｏｐｔｉｃａｌｉｓｏｍｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆｖａｌｉｎｅｍｏｌｅｃｕｌｅｓｗｉｔｈｄｕａｌｈｙｄｒｏｇｅｎｂｏｎｄｓｂｅｔｗｅｅｎ ａｍｉｎｏａｎｄｃａｒｂｏｘｙｌｇｒｏｕｐｓａｎｄｔｈｅｄａｍａｇｅｉｎｄｕｃｅｄｂｙｈｙｄｒｏｘｙｌｒａｄｉｃａｌｓｉｎｗａｔｅｒｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｗｅｒｅｓｔｕｄ ｉｅｄｂｙｕｓｉｎｇＭＰ２／６－３１１＋＋Ｇ（２ｄｆ，ｐｄ）／／Ｂ３ＬＹＰ／６－３１＋Ｇ（ｄ，ｐ）ｄｕａｌｔｈｅｏｒｙａｎｄＳＭＤｍｏｄｅｌ ｍｅｔｈｏｄｆｏｒｓｅｌｆｃｏｎｓｉｓｔｅｎｔｒｅａｃｔｉｏｎｆｉｅｌｄ（ＳＣＲＦ）ｔｈｅｏｒｙ．Ｔｈｅｓｔｕｄｙｏｆｒｅａｃｔｉｏｎｃｈａｎｎｅｌｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅｔｈｒｅｅｃｈａｎｎｅｌｓａ，ｂａｎｄｃｉｎｔｈｅｏｐｔｉｃａｌｉｓｏｍｅｒｒｅａｃｔｉｏ