高分子链穿孔行为的研究-凝聚态物理专业论文.docxVIP

浙 江 浙 江 大 学 硕 士 学 位 论 文 致 谢 本 论 文 及 相 关 工 作 是 在 我 的 导 师 章 林 溪 教 授 的 亲 切 关 怀 和 悉 心 指 导 下 完 成 的 。章 老 师严 肃 的科 学 态 度 ，严 谨 的 治 学 精 神 ，精 益 求 精 的工 作 作 风 ，一 直 深 深 的 感 染 和 激 励 着 我 。 在 此 ，谨 向 章 老 师 致 以诚 挚 的谢 意 和 崇 高 的敬 意 。 感谢 本 课 题 组 的其 他 成 员: 沈 瑜 、苏加 叶 、虞 崇庆 、何林 李 、叶益胜 、温 晓 会 等 。他 们 在 科研 生 活等方 面给 予 我很 大 的帮 助 ，在他 们 的陪伴 下度 过 了愉 快 的 读 研 生 活 。 最 后 感 谢 为 评 审本 论 文 而 付 出辛 勤 劳 动 的全 体 专 家 学者 ! 江 绍 钊 200 9 年 5 月 浙 江 浙 江 大 学 硕 士 学 位 论 文 摘 要 生 物体 内的 很 多 生理 过 程都 涉及 到 蛋 白质 、D N A 和 R N A 等 高分 子 的迁 移 ， 例 如 ，D N A 和 R N A 穿 过 核 孔 ，蛋 白质 穿 过 薄膜 ，病 毒 注 射 入 细 胞 等 等 。 由于 其 在 生 物 技 术 上 的 重 要 价 值 ，科 研 工 作 者 对 生 物 大 分 子 穿 越 纳 米 孔 道 的研 究 十 分 感 兴趣 。对 这 些迁 移 过 程 的研 究有 助 于 我们 更 深 入 地 了解 这 些 生 理 过 程 ，同样 会 产 生 一 些 潜 在 的应 用 前 景 ，例 如 ，D N A 测序 、基 因治 疗 和 可 控 的 药物 输 送 。 在 本 文 第 二 章 中 ，我 们 采 用 分 子 动 力 学 方 法 对 线 型 高分 子 链 穿越 孔 道 的过 程 进行 了模 拟 。结果表 明对 于不 同 的外 电场 力 ，迁 移 时 间 的标 度 行 为都 出现 交叉 现 象 ，并 且 在 短 链 时 符 合 : 一N Zv，在 长 链 时 符 合 : 一N ’+L. 。统 计 了迁 移 时 间 的 分 布 ， 发 现 其 在 峰 值 之 前 的部 分 接 近 高 斯 分布 ，在 峰 值 之 后 的部 分 呈 现 指 数 衰 减 。 在 本 文 第 三 章 中 ，我 们 采 用 分 子 动 力 学 方 法 对 环 型 、打 结 及 折 叠 高分 子链 穿 越 孔 道 的 过 程 进 行 了模 拟 。对 于 环 型 高 分 子 ，在 不 同 外 电场 力 的作 用 下 ，迁 移 时 间 的标 度 行 为 出现 交 叉 现 象 ，并 且 长链 部 分 的标 度 指 数接 近 于 双 链 D N A 穿 孔 实 验 的 结 果 。无 论 是 长 链 还 是 短链 ，其 标 度 指 数 在 数 值 上都 比线 型 高 分 子 的 结 果 要 小 。迁 移 时 间 的 分 布 行 为 与 线 型 高分 子 的 结 果 呈 现 类似 的趋 势 。对 于 打 结 高 分 子 ， 其 迁 移 时 间 的分 布 出现 新 奇 的双 峰 现 象 ，在 主 峰 之 前 ，出现 了次 峰 。 当外 电场 力 增 大 时 ，次峰慢 慢地 变大 ，之后 达 到最 大值 ，接着 又慢 慢减 小 直 至消 失 。对 于 折 叠 高 分 子 ， 对 称 折 叠 与 非 对 称 折 叠 的 高 分 子 对 应 迁 移 时 间 的 分 布 呈 现 不 同 的 趋 势 。对 称 折 叠 高 分 子 迁 移 时 间 的 分 布 与环 型 高分 子 的结果 类似 ，并 且 呈 现 清 晰 的 单 峰 分 布 。 非 对 称 折 叠 高 分 子 迁 移 时 间 的 分 布 则 没 有 出现 清 晰 的 单 峰 。 在 混 合 N D A 穿 孔 实 验 中 ，迁 移 时 间 的分 布 是 否 呈 现 单 峰 ， 可 以 区分 出一 条 高 分 子 是 非 对 称 折 叠 的 ，还 是 对 称 折 叠 或 者 线 型 的 。 在 本 文 第 四章 中 ， 我 们 采 用 分 子 动 力 学 方 法 对 单链 D N A 等 分 子 穿越 孔 道 的 过 程 进 行 了模 拟 ，并 且 在 记 录 D N A 单 体 穿 越 孔 道 的居 留 时 间 的基 础 上 ，提 出 了 一种 预 测 D N A 链 序 列 的 方 法 。 应 用 该 方 法 预 测 了二 十 条 不 同序 列 的 D N A 链 ， 平 均 准 确 率 在 94 .7% 左 右 。 在 单 链 D N A 穿 过 纳 米 孔 道 的 实 验