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- 2018-12-22 发布于福建
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eb病毒lmp2t b细胞重叠表位的预测 筛及鉴定
优秀毕业论文
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温州医学院硕士论文EB
温州医学院硕士论文
EB茄莓LMP2 T、B细胞重叠表位的预测、筛选和鉴定
中文摘要
目的:
基于本实验室对EB病毒(Epstein.Barr virus,EBV)潜伏膜蛋白2fEB Latent membrane protein 2,LMP2)B细胞表位筛选的结果,对已筛选的3个免疫优势B细 胞表位及其上下游的氨基端肽段预测其T表位,进一步筛选和鉴定EBV LMP2 T、 B细胞重叠表位,为其单克隆抗体的制备及EBV相关肿瘤免疫防治研究提供理论 依据。
采用SYFPEITHI细胞表位在线预测服务(http://www.syfpeithi.de/)。运用 SYFPEIn缸服务器上的EPITOPE PREDICTION方法,在本实验室已筛选的3个B细 胞优势表位及其上下游分析预测MOMP的HLA.A*0201限制性细胞毒T细胞 (cytotoxicity T cell,CTL)表位。根据筛选肽上的氨基酸是否为锚定残基、辅助 残基或优势残基进行记分,选择分值较高的氨基酸肽段为免疫优势T细胞表位, 即为EBV LMP2 CTL表位和B细胞重叠表位,并进一步对筛选的T、B细胞重叠表 位进行鉴定和免疫效应的研究。
方法:
1.EBV LMP2 HLA—A*0201限制性CTL和B细胞重叠表位的预测
从SwissProt蛋白数据库获得EBVLMP2的氨基酸序列,以数据库Syfpeithi、 NetCTL为主、并结合HLA.Bind、Rankpep等在线软件,对本实验室已鉴定的3个 EBV LMP2免疫优势B细胞表位及其上下游肽段,分别预测EBV LMP2中 HLA.A*0201限制性CD8+CTL表位,结果其中2个B细胞表位上下游分别重叠含 CTL表位,选择CTL和IB细胞表位重叠的EBV LMP2中的氨基酸短肽,作为T、B 细胞重叠优势表位为目的表位进行鉴定,并进一步进行免疫效应的研究。
2.表位肽的合成
由西安华辰生物科技有限公司采用标准固相肽合成Fmoc方案进行合成,采用 高效液相色谱法IqPLC纯化及进行质谱法分析鉴定。 3.CTL和B细胞重叠表位肽的鉴定
对上述合成的CTL和B细胞重叠表位肽作进一步鉴定。
(1)重叠表位肽的CTL表位活性鉴定:①利用T2细胞分析预测的重叠肽与 HLA.A*0201分子结合的亲和稳定性:②利用乳酸脱氢酶(LDH)释放法,检测重叠
温州医学院硕士论文表位肽诱导的体外细胞毒杀伤活性;
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表位肽诱导的体外细胞毒杀伤活性;③通过ELISPOT和细胞内细胞因子染色 (ICS)方法,检测重叠表位肽刺激其特异性CTL细胞分泌的IFN,水平,鉴定EBV LMP2的HLA-A*0 201限制性CTL表位的活性。
(2)重叠表位肽的B细胞表位活性鉴定:利用动物免疫的方法,即采用纯化 的合成肽偶联BSA,在BALB/C雌性小鼠(5只/组)后背部皮下多点免疫注射,以 沙眼衣原体(ct)主要外膜蛋白(MOMP)表位肽偶联BSA为对照,共免疫3次,间隔 两周,于免疫第0w,1w,3w,5w,7w,9w周分别收集血清,制备免疫血清抗 体。采用间接ELISA方法检测重叠表位肽在不同免疫时间段的抗体效价,免疫原 性,及其诱导抗体与EBV抗原的结合能力是否受CTL表位存在的影响。
结果: 1.CTL和B细胞重叠表位预测结果及初步筛选
根据Syfpeithi预测,以本实验室对EBV LMP2的B细胞表位鉴定结果为基础, 选择含分值较高的HLA-A*0201限制性CTL表位RIEDPPFNSL(199~2081、 LSSTEFIPNL(383-392)作为目的CTL和B细胞重叠表位肽,分别命名为EBpl3、 EBpl4。同时以HLA.A241j艮锖tJ性表位肽TYGPVFMCL(419~427)作为阴性对照, 以HLA—A*0201限制性CTL表位肽LLWTLVVLL(329~337)作为阳性对照,分别命
名为EBpl 1N EBpl2。
2.重叠表位肽的合成
由西安华辰生物科技有限公司采用标准固相肽合成Fmoc方案合成,经高效液 相色谱法HPLC纯化,以此获得纯度接近或高于95%的肽产物,经质谱法MS鉴定 氨基酸的序列,同时测定分子量,所得测定值与理论值相符。成功获得了高纯度 的合成肽EBpl 1、EBpl2、EBpl3矛IEBpl4,为进一步表位鉴定奠定了基础
3.重叠表位肽的进一步鉴定 (1)肽亲和稳定实验结果:显示重叠表位肽EBpl3、EBpl4与T2细胞的结合
亲和力(FI)分别为3.21、2.24,稳定性DC50均8h;阳性肽EBpl2与阴性肽 EBpll的亲和力(FI)分别为5.00和1.58,稳定性DC50分别为8h和2h。 本实验筛选的
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