生物化学第三版14RNA生物合成.pptVIP

* * ⑶tRNA前体 MCB-12-528 * RNA折叠成一种稳定的发夹结构，这种RNA-RNA配对比通常生生在转录泡内的DNA-RNA配对更具有热力学上的稳定性，因而减弱了模板和转录物之间的相互作用，有利于解离。模板和转录物之间的相互作用在模板中的一串U之后进一步被减弱，因为形成的A-U碱基对只有两个氢键，而GC配对有三个氢键，结果将造成终止。 * ρ因子与新生RNA链的终止子上游某位点结合。这可能需要特殊序列，粘附仅发生在游离5￠末端或其它暴露序列，然后ρ因子沿mRNA 转位。 * Does rho factor act via recognizing DNA, RNA, or RNA polymerase? Rho has an ATPase activity, which is RNA-dependent and requires the presence of a polyribonucleotide, 50 or so bases long. This suggests that rho binds RNA. Probably an individual rho factor acts processively on a single RNA substrate. The hot pursuit model for rho action shown in Figure 9.28 supposes that it binds to a nascent RNA chain at some point upstream of the terminator. This might require a specific sequence or type of sequence, or attachment could occur just at a free 5 end or some other exposed sequence. Rho then translocates along the mRNA. 九、Rho因子是如何起作用的？ Rho因子只在终止阶段起作用。它是一个大约46KD的蛋白质，大概只在六聚体的形式中具有活性。它作用RNA聚合酶的一个辅助因子起作用，在体外，当它的浓度达到RNA聚合酶的浓度的1/10时，通常活性最大。 Rho因子是通过辨认DNA，RNA或是RNA聚合酶而起作用的吗？ 11.27 rho因子沿RNA跟随RNA聚合酶，当聚合酶在一个依靠rho的终止子停下时，它就引起终止。 Rho有ATP酶的作用，其依赖于RNA并且需要一个250碱基左右的多核苷酸链。这也就是说rho与RNA结合，可能是每一个独立的rho因子在单链RNA底物上移动地起作用。图11.27显示了rho起作用“热点追踪”模型。它假设Rho在终止子上游的某点与新合成RNA结合时，尽管只能发生在自由 端或某些暴露的序列中，仍然需要某个或某种特殊的序列，然后Rho沿着mRNA移动。 Rho是怎样赶上RNA聚合酶的呢？一种可能性是rho沿转录体的速度比RNA聚合酶沿DNA移动的速度要快。当酶遇到终止子暂停时，如果rho赶上了它，终止就会发生。 Rho是直接作用于DNA-RNA联体从而释放转录体还是间接地使RNA聚合酶释放RNA的呢？在RNA聚合酶缺省的条件下，rho具有使RNA-DNA杂合体分解的从5′端到3′端的解螺旋作用；ATP水解用以给这个反应供应能量。 Rho沿RNA移动的观点导致了转录与翻译关系的一个重要预测。Rho必须首先接近并进行一个结合序列（在RNA上），然后必须能够沿着它移动。如果核糖体正在翻译一个RNA，前两者情况或者至少有一种情况将被阻止。就这样，rho因子在终止子赶上酶的能力就取决于翻译过程中发生了什么。 * * 第十四章 RNA的生物合成 RNA合成也需要模板，可以是DNA也可以是RNA。 RNA聚合酶以DNA为模板催化合成RNA的过程称为转录。 * * 第一节 转录的基本特征 转录是遗传信息由DNA向RNA传递的过程，即一股DNA的碱基序列按照碱基配对原则指导RNA聚合酶合成与之序列互补RNA的过程。 转录是中心法则的关键，转录产物RNA在DNA与蛋白质之间建立联系。 参与转录的主要物质 * * 转录的基本特征 1.选择性转录：细胞在不同的生长阶段，根据生存条件和代谢需要转录不同的基因，因而表达的只是基因组的一部分 。 2.不对称转录 ：DNA的每一个转录区都只有一股链可以被转录。 模板链/负链/反义链：被转录，序列与转录产物互补。 编码链/正链/有义链：不被转录，序列与转录产物一致。 双链DNA 每一股链都可能含指导RNA合成的模板。 3.转录后加工：初级转录产物大多数需